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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.64016Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 148 / 3316537 66 / 2498449 2103 / 114162531 3305 / 109592465 148 / 3316537 66 / 2498449 2103 / 114162531 3305 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 2 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 10 / 506301 4 / 200215   53 / 4997811 10 / 506301 4 / 200215 0 / 729526 53 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 14 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 14 / 778035
cerebellum       1 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 1 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   11 / 151167   4 / 643586 0 / 26551 11 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826     355 / 12434232 7 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 355 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 1 / 12721   -- 2 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 12 / 106627 1 / 89898 1 / 155372   12 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 12 / 96846 5 / 107249 1 / 66308   12 / 96846 5 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 10 / 128150 1 / 170663   1 / 159059 10 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node     5 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 5 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     251 / 43166038 548 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 251 / 43166038 548 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     2 / 94887 3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 3 / 179472
pancreas   1 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 9 / 96524   -- -- 9 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088   1 / 207348 -- 20 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       1 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina 1 / 29438 -- 3 / 820326   1 / 29438 -- 3 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 19 / 73633 5 / 125377 1528 / 26905847 2309 / 34522313 19 / 73633 5 / 125377 1528 / 26905847 2309 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 13 / 6230144 -- -- -- 13 / 6230144 --
stomach   5 / 65644     0 / 26641 5 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 2 / 100058 -- 12 / 12372003 2 / 143630 2 / 100058 -- 12 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   9 / 32606     0 / 11737 9 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 7 / 479819     1 / 207932 7 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 8 / 38063 3 / 133582 108 / 10193077 -- 8 / 38063 3 / 133582 108 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 182 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 182 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --