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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.638376Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES     86 / 114162531 328 / 109592465 0 / 3316537 0 / 2498449 86 / 114162531 328 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     28 / 5047110 23 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 28 / 5047110 23 / 4978364
brain     5 / 729526 17 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 5 / 729526 17 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum     1 / 90885 8 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 8 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       7 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 7 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       8 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 8 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney       1 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       12 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 12 / 214987
lung     1 / 159917 1 / 159059 0 / 128150 0 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node     1 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 1 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     18 / 43166038 196 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 18 / 43166038 196 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       4 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 4 / 491794
retina   -- 8 / 820326   0 / 29438 -- 8 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     11 / 26905847 40 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 11 / 26905847 40 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2 / 6230144 -- -- -- 2 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 7 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 7 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue       1 / 51729 0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus     2 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 2 / 10193077 --
vascular   -- 5 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 5 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --