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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.637001Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 131 / 3316537 88 / 2498449 1282 / 114162531 2575 / 109592465 131 / 3316537 88 / 2498449 1282 / 114162531 2575 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 --   0 / 16077 6 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   181 / 5047110 302 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 181 / 5047110 302 / 4978364
brain 16 / 506301 8 / 200215 9 / 729526 124 / 4997811 16 / 506301 8 / 200215 9 / 729526 124 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 23 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 23 / 778035
cerebellum 3 / 90353   1 / 90885 34 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 1 / 90885 34 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   7 / 151167 1 / 98089 8 / 643586 0 / 26551 7 / 151167 1 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 2 / 46440   82 / 12434232 7 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 82 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 7 / 106627 3 / 89898 3 / 155372   7 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308   3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 9 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 6 / 159059 9 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 6 / 159059
lymph node 2 / 62650   85 / 5278419 202 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 85 / 5278419 202 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   8 / 104307 278 / 43166038 957 / 30312656 0 / 46553 8 / 104307 278 / 43166038 957 / 30312656
muscle 2 / 74039 3 / 27691     2 / 74039 3 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 4 / 89988 5 / 94887 9 / 179472 2 / 11462 4 / 89988 5 / 94887 9 / 179472
pancreas   3 / 74930 2 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 2 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891 1 / 645 -- -- 2 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 7 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 9 / 107080 11 / 266949 20 / 491794 6 / 79993 9 / 107080 11 / 266949 20 / 491794
retina   -- 2 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 2 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 7 / 125377 150 / 26905847 252 / 34522313 1 / 73633 7 / 125377 150 / 26905847 252 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 212 / 6230144 -- -- -- 212 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 2 / 65644 7 / 124767 21 / 448716 2 / 26641 2 / 65644 7 / 124767 21 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 15 / 143630 2 / 100058 -- 525 / 12372003 15 / 143630 2 / 100058 -- 525 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 6 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 6 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 10 / 479819   1 / 51729 7 / 207932 10 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 5 / 38063 1 / 133582 116 / 10193077 -- 5 / 38063 1 / 133582 116 / 10193077 --
vascular   -- 195 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 195 / 13135050 --
white blood cells -- -- 12 / 846268 -- -- -- 12 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --