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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.632486Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 591 / 3316537 542 / 2498449 19860 / 114162531 24487 / 109592465 591 / 3316537 542 / 2498449 19860 / 114162531 24487 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 26 / 57865 --   5 / 16077 26 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 7 / 29891 822 / 5047110 830 / 4978364 1 / 14774 7 / 29891 822 / 5047110 830 / 4978364
brain 68 / 506301 22 / 200215 91 / 729526 713 / 4997811 68 / 506301 22 / 200215 91 / 729526 713 / 4997811
cartilage 2 / 15965 6 / 37226 -- 49 / 778035 2 / 15965 6 / 37226 -- 49 / 778035
cerebellum 6 / 90353   1 / 90885 79 / 1495938 6 / 90353 0 / 0 1 / 90885 79 / 1495938
cerebrum 25 / 198932   -- -- 25 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 9 / 44577 -- -- 1 / 3888 9 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 25 / 151167 20 / 98089 19 / 643586 2 / 26551 25 / 151167 20 / 98089 19 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 52 / 246043   -- -- 52 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 22 / 128826 7 / 46440 6 / 85898 4587 / 12434232 22 / 128826 7 / 46440 6 / 85898 4587 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 -- 3 / 28803 4 / 12721 1 / 45908 --
heart 5 / 76442   8 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 8 / 83063 --
kidney 16 / 106627 14 / 89898 16 / 155372 5 / 100281 16 / 106627 14 / 89898 16 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 24 / 96846 18 / 107249 4 / 66308 44 / 214987 24 / 96846 18 / 107249 4 / 66308 44 / 214987
lung 21 / 128150 26 / 170663 27 / 159917 34 / 159059 21 / 128150 26 / 170663 27 / 159917 34 / 159059
lymph node 34 / 62650 11 / 27007 685 / 5278419 62 / 4863489 34 / 62650 11 / 27007 685 / 5278419 62 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 5 / 44303 -- -- 1 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland 12 / 46553 16 / 104307 10895 / 43166038 14031 / 30312656 12 / 46553 16 / 104307 10895 / 43166038 14031 / 30312656
muscle 9 / 74039   4 / 107836 7 / 61270 9 / 74039 0 / 27691 4 / 107836 7 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 24 / 89988 14 / 94887 33 / 179472 2 / 11462 24 / 89988 14 / 94887 33 / 179472
pancreas   14 / 74930 12 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 14 / 74930 12 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 16 / 96524 3 / 30072 -- -- 16 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 10 / 14891   -- -- 10 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 52 / 241088 9 / 39531 20 / 207348 -- 52 / 241088 9 / 39531 20 / 207348 --
pooled tissue 59 / 276455   -- -- 59 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 5 / 107080 15 / 266949 37 / 491794 7 / 79993 5 / 107080 15 / 266949 37 / 491794
retina 5 / 29438 -- 57 / 820326 17 / 88490 5 / 29438 -- 57 / 820326 17 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 11 / 125377 2286 / 26905847 2610 / 34522313 7 / 73633 11 / 125377 2286 / 26905847 2610 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 11 / 52939   -- -- 11 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 802 / 6230144 -- -- -- 802 / 6230144 --
stomach 9 / 26641 19 / 65644 10 / 124767 52 / 448716 9 / 26641 19 / 65644 10 / 124767 52 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 17 / 143630 54 / 100058 -- 1221 / 12372003 17 / 143630 54 / 100058 -- 1221 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 9 / 32606 71 / 115938 42 / 124664 2 / 11737 9 / 32606 71 / 115938 42 / 124664
uncharacterized tissue 48 / 207932 92 / 479819 1 / 21833 3 / 51729 48 / 207932 92 / 479819 1 / 21833 3 / 51729
uterus 12 / 38063 96 / 133582 1778 / 10193077 -- 12 / 38063 96 / 133582 1778 / 10193077 --
vascular 11 / 46250 -- 1690 / 13135050 -- 11 / 46250 -- 1690 / 13135050 --
white blood cells -- -- 524 / 846268 -- -- -- 524 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --