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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.632403Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 90 / 3316537 162 / 2498449 8259 / 114162531 2205 / 109592465 90 / 3316537 162 / 2498449 8259 / 114162531 2205 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 25 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 25 / 83577
bone marrow   2 / 29891 9 / 5047110 12 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 9 / 5047110 12 / 4978364
brain 14 / 506301 14 / 200215 116 / 729526 373 / 4997811 14 / 506301 14 / 200215 116 / 729526 373 / 4997811
cartilage 3 / 15965   -- 58 / 778035 3 / 15965 0 / 37226 -- 58 / 778035
cerebellum     2 / 90885 101 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 101 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon   7 / 151167 3 / 98089 55 / 643586 0 / 26551 7 / 151167 3 / 98089 55 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 16 / 246043   -- -- 16 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 10 / 128826 5 / 46440 7 / 85898 110 / 12434232 10 / 128826 5 / 46440 7 / 85898 110 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 4 / 89898 7 / 155372 6 / 100281 1 / 106627 4 / 89898 7 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   7 / 107249 1 / 66308 9 / 214987 0 / 96846 7 / 107249 1 / 66308 9 / 214987
lung 5 / 128150 7 / 170663 11 / 159917 2 / 159059 5 / 128150 7 / 170663 11 / 159917 2 / 159059
lymph node     19 / 5278419 8 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 19 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   11 / 104307 7326 / 43166038 854 / 30312656 0 / 46553 11 / 104307 7326 / 43166038 854 / 30312656
muscle   2 / 27691 6 / 107836 1 / 61270 0 / 74039 2 / 27691 6 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 3 / 89988 8 / 94887 9 / 179472 1 / 11462 3 / 89988 8 / 94887 9 / 179472
pancreas   8 / 74930 2 / 85728 13 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 2 / 85728 13 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 2 / 30072 -- -- 4 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 2 / 39531 4 / 207348 -- 3 / 241088 2 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   6 / 107080 11 / 266949 26 / 491794 0 / 79993 6 / 107080 11 / 266949 26 / 491794
retina   -- 23 / 820326 11 / 88490 0 / 29438 -- 23 / 820326 11 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 2 / 125377 169 / 26905847 309 / 34522313 6 / 73633 2 / 125377 169 / 26905847 309 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 160 / 6230144 -- -- -- 160 / 6230144 --
stomach   6 / 65644 2 / 124767 17 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 2 / 124767 17 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 3 / 100058 -- 199 / 12372003 1 / 143630 3 / 100058 -- 199 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   1 / 115938 2 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 49 / 479819   5 / 51729 4 / 207932 49 / 479819 0 / 21833 5 / 51729
uterus 1 / 38063 9 / 133582 189 / 10193077 -- 1 / 38063 9 / 133582 189 / 10193077 --
vascular   -- 180 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 180 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --