Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.610830Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1246 / 3316537 1114 / 2498449 10136 / 114162531 5432 / 109592465 1246 / 3316537 1114 / 2498449 10136 / 114162531 5432 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 10 / 16077 17 / 57865 -- 54 / 83577 10 / 16077 17 / 57865 -- 54 / 83577
bone marrow 3 / 14774 31 / 29891 11 / 5047110 6 / 4978364 3 / 14774 31 / 29891 11 / 5047110 6 / 4978364
brain 226 / 506301 187 / 200215 65 / 729526 392 / 4997811 226 / 506301 187 / 200215 65 / 729526 392 / 4997811
cartilage 26 / 15965 12 / 37226 -- 275 / 778035 26 / 15965 12 / 37226 -- 275 / 778035
cerebellum 52 / 90353   7 / 90885 59 / 1495938 52 / 90353 0 / 0 7 / 90885 59 / 1495938
cerebrum 76 / 198932 2 / 3422 -- -- 76 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix 4 / 3888 24 / 44577 -- -- 4 / 3888 24 / 44577 -- --
colon 11 / 26551 54 / 151167 14 / 98089 125 / 643586 11 / 26551 54 / 151167 14 / 98089 125 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 47 / 246043   -- -- 47 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 22 / 19564   -- -- 22 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   6 / 17290 -- -- 0 / 270 6 / 17290 -- --
eye 29 / 128826 13 / 46440 23 / 85898 171 / 12434232 29 / 128826 13 / 46440 23 / 85898 171 / 12434232
gastrointestinal tract 33 / 28803 11 / 12721   -- 33 / 28803 11 / 12721 0 / 45908 --
heart 24 / 76442     -- 24 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 59 / 106627 26 / 89898 27 / 155372 20 / 100281 59 / 106627 26 / 89898 27 / 155372 20 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 12 / 96846 58 / 107249 4 / 66308 14 / 214987 12 / 96846 58 / 107249 4 / 66308 14 / 214987
lung 61 / 128150 33 / 170663 16 / 159917 17 / 159059 61 / 128150 33 / 170663 16 / 159917 17 / 159059
lymph node 8 / 62650 3 / 27007 157 / 5278419 14 / 4863489 8 / 62650 3 / 27007 157 / 5278419 14 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 32 / 44303 -- -- 1 / 17836 32 / 44303 -- --
mammary gland 12 / 46553 45 / 104307 7709 / 43166038 1530 / 30312656 12 / 46553 45 / 104307 7709 / 43166038 1530 / 30312656
muscle 4 / 74039 17 / 27691 5 / 107836 3 / 61270 4 / 74039 17 / 27691 5 / 107836 3 / 61270
nervous 8 / 10333   -- -- 8 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 47 / 89988 8 / 94887 47 / 179472 3 / 11462 47 / 89988 8 / 94887 47 / 179472
pancreas   20 / 74930 16 / 85728 39 / 189999 0 / 7237 20 / 74930 16 / 85728 39 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 5 / 30072 -- -- 1 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260 1 / 1358 -- -- 2 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 107 / 241088 5 / 39531 4 / 207348 -- 107 / 241088 5 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 28 / 276455   -- -- 28 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 38 / 79993 41 / 107080 22 / 266949 83 / 491794 38 / 79993 41 / 107080 22 / 266949 83 / 491794
retina 13 / 29438 -- 46 / 820326 3 / 88490 13 / 29438 -- 46 / 820326 3 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 27 / 73633 59 / 125377 507 / 26905847 1557 / 34522313 27 / 73633 59 / 125377 507 / 26905847 1557 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 74 / 52939   -- -- 74 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 264 / 6230144 -- -- -- 264 / 6230144 --
stomach 11 / 26641 10 / 65644   34 / 448716 11 / 26641 10 / 65644 0 / 124767 34 / 448716
synovium   2 / 1650 -- -- 0 / 249 2 / 1650 -- --
testis 74 / 143630 101 / 100058 -- 984 / 12372003 74 / 143630 101 / 100058 -- 984 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 11 / 11737 10 / 32606 2 / 115938 2 / 124664 11 / 11737 10 / 32606 2 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 71 / 207932 209 / 479819 4 / 21833 3 / 51729 71 / 207932 209 / 479819 4 / 21833 3 / 51729
uterus 10 / 38063 25 / 133582 766 / 10193077 -- 10 / 38063 25 / 133582 766 / 10193077 --
vascular 40 / 46250 -- 390 / 13135050 -- 40 / 46250 -- 390 / 13135050 --
white blood cells -- -- 69 / 846268 -- -- -- 69 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --