Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.603842Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 60 / 3316537 42 / 2498449 262 / 114162531 316 / 109592465 60 / 3316537 42 / 2498449 262 / 114162531 316 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 16 / 506301 5 / 200215 35 / 729526 106 / 4997811 16 / 506301 5 / 200215 35 / 729526 106 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum       19 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 19 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 1 / 151167     1 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826   1 / 85898 110 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 110 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 6 / 106627 1 / 89898 6 / 155372   6 / 106627 1 / 89898 6 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung   2 / 170663 1 / 159917   0 / 128150 2 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 4 / 43166038 22 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 4 / 43166038 22 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas       1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet   6 / 30072 -- -- 0 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088     -- 1 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 2 / 107080     3 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina 1 / 29438 -- 20 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 20 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 53 / 26905847 41 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 53 / 26905847 41 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 21 / 6230144 -- -- -- 21 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 9 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 9 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 2 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 2 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue   16 / 479819     0 / 207932 16 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   1 / 133582 109 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 109 / 10193077 --
vascular   -- 8 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 8 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --