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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.59523Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 105 / 3316537 47 / 2498449 5534 / 114162531 4779 / 109592465 105 / 3316537 47 / 2498449 5534 / 114162531 4779 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     21 / 5047110 17 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 21 / 5047110 17 / 4978364
brain 29 / 506301 7 / 200215 23 / 729526 253 / 4997811 29 / 506301 7 / 200215 23 / 729526 253 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 8 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 3 / 90353   2 / 90885 65 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 2 / 90885 65 / 1495938
cerebrum 8 / 198932   -- -- 8 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551     8 / 643586 1 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 12 / 246043   -- -- 12 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 1 / 128826   1 / 85898 797 / 12434232 1 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 797 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 6 / 76442   3 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 5 / 106627 2 / 89898 11 / 155372 1 / 100281 5 / 106627 2 / 89898 11 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 8 / 214987 4 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 8 / 214987
lung 4 / 128150   5 / 159917   4 / 128150 0 / 170663 5 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650 1 / 27007 317 / 5278419 132 / 4863489 1 / 62650 1 / 27007 317 / 5278419 132 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 496 / 43166038 1539 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 496 / 43166038 1539 / 30312656
muscle 1 / 74039     1 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 4 / 179472
pancreas   1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet   2 / 30072 -- -- 0 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088   11 / 207348 -- 2 / 241088 0 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993   13 / 266949 14 / 491794 3 / 79993 0 / 107080 13 / 266949 14 / 491794
retina   -- 28 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 28 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 2612 / 26905847 1163 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 2612 / 26905847 1163 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 314 / 6230144 -- -- -- 314 / 6230144 --
stomach     3 / 124767 13 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 3 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 10 / 100058 -- 749 / 12372003 12 / 143630 10 / 100058 -- 749 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   10 / 115938 3 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 10 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 17 / 479819 1 / 21833   1 / 207932 17 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus     958 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 958 / 10193077 --
vascular   -- 685 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 685 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --