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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.593923Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 662 / 3316537 408 / 2498449 10568 / 114162531 14038 / 109592465 662 / 3316537 408 / 2498449 10568 / 114162531 14038 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 7 / 16077 2 / 57865 --   7 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 5 / 29891 1414 / 5047110 2762 / 4978364 1 / 14774 5 / 29891 1414 / 5047110 2762 / 4978364
brain 115 / 506301 46 / 200215 107 / 729526 524 / 4997811 115 / 506301 46 / 200215 107 / 729526 524 / 4997811
cartilage 9 / 15965 9 / 37226 -- 81 / 778035 9 / 15965 9 / 37226 -- 81 / 778035
cerebellum 14 / 90353   17 / 90885 255 / 1495938 14 / 90353 0 / 0 17 / 90885 255 / 1495938
cerebrum 26 / 198932   -- -- 26 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 18 / 151167 4 / 98089 17 / 643586 2 / 26551 18 / 151167 4 / 98089 17 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 57 / 246043   -- -- 57 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 1 / 2857 -- -- 4 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   6 / 17290 -- -- 0 / 270 6 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 10 / 46440 10 / 85898 702 / 12434232 17 / 128826 10 / 46440 10 / 85898 702 / 12434232
gastrointestinal tract 12 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 -- 12 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 --
heart 20 / 76442   2 / 83063 -- 20 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 29 / 106627 14 / 89898 5 / 155372 1 / 100281 29 / 106627 14 / 89898 5 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 27 / 107249 1 / 66308 11 / 214987 7 / 96846 27 / 107249 1 / 66308 11 / 214987
lung 24 / 128150 20 / 170663 10 / 159917 17 / 159059 24 / 128150 20 / 170663 10 / 159917 17 / 159059
lymph node 5 / 62650 2 / 27007 339 / 5278419 100 / 4863489 5 / 62650 2 / 27007 339 / 5278419 100 / 4863489
lymphoreticular   7 / 44303 -- -- 0 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland 19 / 46553 21 / 104307 4817 / 43166038 5330 / 30312656 19 / 46553 21 / 104307 4817 / 43166038 5330 / 30312656
muscle 13 / 74039 3 / 27691   2 / 61270 13 / 74039 3 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 10 / 89988 5 / 94887 7 / 179472 2 / 11462 10 / 89988 5 / 94887 7 / 179472
pancreas 3 / 7237 7 / 74930 12 / 85728 15 / 189999 3 / 7237 7 / 74930 12 / 85728 15 / 189999
pancreatic islet 29 / 96524   -- -- 29 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 33 / 241088 5 / 39531 10 / 207348 -- 33 / 241088 5 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 23 / 276455   -- -- 23 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 13 / 79993 9 / 107080 7 / 266949 27 / 491794 13 / 79993 9 / 107080 7 / 266949 27 / 491794
retina 9 / 29438 -- 73 / 820326 5 / 88490 9 / 29438 -- 73 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 36 / 73633 27 / 125377 1438 / 26905847 2822 / 34522313 36 / 73633 27 / 125377 1438 / 26905847 2822 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 16 / 52939   -- -- 16 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 760 / 6230144 -- -- -- 760 / 6230144 --
stomach 7 / 26641 10 / 65644 20 / 124767 27 / 448716 7 / 26641 10 / 65644 20 / 124767 27 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 29 / 143630 37 / 100058 -- 1326 / 12372003 29 / 143630 37 / 100058 -- 1326 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 6 / 124664 2 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 46 / 207932 84 / 479819 2 / 21833 1 / 51729 46 / 207932 84 / 479819 2 / 21833 1 / 51729
uterus 10 / 38063 20 / 133582 944 / 10193077 -- 10 / 38063 20 / 133582 944 / 10193077 --
vascular 15 / 46250 -- 505 / 13135050 -- 15 / 46250 -- 505 / 13135050 --
white blood cells -- -- 60 / 846268 -- -- -- 60 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --