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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.593148Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 489 / 3316537 152 / 2498449 8891 / 114162531 5414 / 109592465 489 / 3316537 152 / 2498449 8891 / 114162531 5414 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 --   0 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 1 / 5047110   0 / 14774 2 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 137 / 506301 8 / 200215 25 / 729526 234 / 4997811 137 / 506301 8 / 200215 25 / 729526 234 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 7 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 18 / 90353   2 / 90885 73 / 1495938 18 / 90353 0 / 0 2 / 90885 73 / 1495938
cerebrum 54 / 198932   -- -- 54 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 5 / 151167   7 / 643586 1 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 7 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 20 / 246043   -- -- 20 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 14 / 128826   4 / 85898 996 / 12434232 14 / 128826 0 / 46440 4 / 85898 996 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 3 / 12721   -- 3 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   4 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 11 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 1 / 100281 11 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 4 / 107249   6 / 214987 8 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 6 / 214987
lung 10 / 128150 4 / 170663 6 / 159917 3 / 159059 10 / 128150 4 / 170663 6 / 159917 3 / 159059
lymph node 44 / 62650 6 / 27007 1537 / 5278419 345 / 4863489 44 / 62650 6 / 27007 1537 / 5278419 345 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 1 / 44303 -- -- 2 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 26 / 43166038 1016 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 26 / 43166038 1016 / 30312656
muscle 5 / 74039   3 / 107836   5 / 74039 0 / 27691 3 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 1 / 94887 2 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas 3 / 7237 6 / 74930   5 / 189999 3 / 7237 6 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 8 / 30072 -- -- 3 / 96524 8 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 46 / 241088 1 / 39531 11 / 207348 -- 46 / 241088 1 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 39 / 276455   -- -- 39 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 6 / 107080 3 / 266949 2 / 491794 6 / 79993 6 / 107080 3 / 266949 2 / 491794
retina 1 / 29438 -- 45 / 820326 3 / 88490 1 / 29438 -- 45 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 16 / 125377 5157 / 26905847 2526 / 34522313 9 / 73633 16 / 125377 5157 / 26905847 2526 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 143 / 6230144 -- -- -- 143 / 6230144 --
stomach   10 / 65644 5 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 10 / 65644 5 / 124767 14 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 10 / 100058 -- 166 / 12372003 1 / 143630 10 / 100058 -- 166 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 11 / 115938 8 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 11 / 115938 8 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 30 / 479819     21 / 207932 30 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 10 / 38063 11 / 133582 365 / 10193077 -- 10 / 38063 11 / 133582 365 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 1514 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 1514 / 13135050 --
white blood cells -- -- 24 / 846268 -- -- -- 24 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --