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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.5930Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 249 / 3316537 181 / 2498449 1151 / 114162531 2228 / 109592465 249 / 3316537 181 / 2498449 1151 / 114162531 2228 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 3 / 57865 --   1 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   7 / 29891 33 / 5047110 20 / 4978364 0 / 14774 7 / 29891 33 / 5047110 20 / 4978364
brain 50 / 506301 14 / 200215 8 / 729526 86 / 4997811 50 / 506301 14 / 200215 8 / 729526 86 / 4997811
cartilage 4 / 15965 5 / 37226 -- 60 / 778035 4 / 15965 5 / 37226 -- 60 / 778035
cerebellum 4 / 90353     24 / 1495938 4 / 90353 0 / 0 0 / 90885 24 / 1495938
cerebrum 18 / 198932   -- -- 18 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 11 / 151167   6 / 643586 1 / 26551 11 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 23 / 246043   -- -- 23 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 2 / 46440   108 / 12434232 4 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 108 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803   2 / 45908 -- 4 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 12 / 106627 4 / 89898     12 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 7 / 107249 3 / 66308 2 / 214987 2 / 96846 7 / 107249 3 / 66308 2 / 214987
lung 7 / 128150 7 / 170663 6 / 159917 5 / 159059 7 / 128150 7 / 170663 6 / 159917 5 / 159059
lymph node 4 / 62650 3 / 27007 104 / 5278419 214 / 4863489 4 / 62650 3 / 27007 104 / 5278419 214 / 4863489
lymphoreticular   5 / 44303 -- -- 0 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland   10 / 104307 28 / 43166038 676 / 30312656 0 / 46553 10 / 104307 28 / 43166038 676 / 30312656
muscle 3 / 74039 4 / 27691 1 / 107836   3 / 74039 4 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988 1 / 94887 3 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 1 / 94887 3 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 4 / 30072 -- -- 1 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 26 / 241088 5 / 39531 7 / 207348 -- 26 / 241088 5 / 39531 7 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 3 / 107080 5 / 266949 6 / 491794 6 / 79993 3 / 107080 5 / 266949 6 / 491794
retina   -- 12 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 12 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 4 / 125377 509 / 26905847 827 / 34522313 9 / 73633 4 / 125377 509 / 26905847 827 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 82 / 6230144 -- -- -- 82 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 7 / 65644 2 / 124767 10 / 448716 2 / 26641 7 / 65644 2 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 14 / 100058 -- 170 / 12372003 6 / 143630 14 / 100058 -- 170 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   5 / 32606 2 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 5 / 32606 2 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 39 / 479819   3 / 51729 18 / 207932 39 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus   6 / 133582 148 / 10193077 -- 0 / 38063 6 / 133582 148 / 10193077 --
vascular 6 / 46250 -- 186 / 13135050 -- 6 / 46250 -- 186 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --