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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.592455Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1957 / 3316537 811 / 2498449 208 / 114162531 253 / 109592465 1957 / 3316537 811 / 2498449 208 / 114162531 253 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 17 / 57865 --   2 / 16077 17 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 50 / 14774 25 / 29891 20 / 5047110   50 / 14774 25 / 29891 20 / 5047110 0 / 4978364
brain 325 / 506301 70 / 200215   9 / 4997811 325 / 506301 70 / 200215 0 / 729526 9 / 4997811
cartilage 11 / 15965 5 / 37226 --   11 / 15965 5 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 204 / 90353     1 / 1495938 204 / 90353 0 / 0 0 / 90885 1 / 1495938
cerebrum 108 / 198932   -- -- 108 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 5 / 3888 9 / 44577 -- -- 5 / 3888 9 / 44577 -- --
colon 9 / 26551 24 / 151167     9 / 26551 24 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 127 / 246043   -- -- 127 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 26 / 19564 2 / 2857 -- -- 26 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270 7 / 17290 -- -- 1 / 270 7 / 17290 -- --
eye 25 / 128826 12 / 46440     25 / 128826 12 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract 65 / 28803 6 / 12721   -- 65 / 28803 6 / 12721 0 / 45908 --
heart 61 / 76442     -- 61 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 68 / 106627 33 / 89898     68 / 106627 33 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 28 / 96846 35 / 107249   1 / 214987 28 / 96846 35 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 112 / 128150 32 / 170663     112 / 128150 32 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 5 / 62650 13 / 27007 2 / 5278419 2 / 4863489 5 / 62650 13 / 27007 2 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 7 / 44303 -- -- 5 / 17836 7 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 26 / 104307 144 / 43166038 170 / 30312656 9 / 46553 26 / 104307 144 / 43166038 170 / 30312656
muscle 10 / 74039 6 / 27691 1 / 107836   10 / 74039 6 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 13 / 11462 12 / 89988     13 / 11462 12 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas 5 / 7237 11 / 74930   1 / 189999 5 / 7237 11 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 54 / 96524 8 / 30072 -- -- 54 / 96524 8 / 30072 -- --
parathyroid   13 / 20557 -- -- 0 / 24 13 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 4 / 6170 -- -- -- 4 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260 1 / 1358 -- -- 5 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 38 / 241088 14 / 39531 1 / 207348 -- 38 / 241088 14 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 127 / 276455   -- -- 127 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 41 / 79993 32 / 107080   1 / 491794 41 / 79993 32 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina 8 / 29438 -- 1 / 820326   8 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 32 / 73633 51 / 125377 24 / 26905847 49 / 34522313 32 / 73633 51 / 125377 24 / 26905847 49 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 39 / 52939   -- -- 39 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 6 / 6230144 -- -- -- 6 / 6230144 --
stomach 45 / 26641 17 / 65644   1 / 448716 45 / 26641 17 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium 5 / 249   -- -- 5 / 249 0 / 1650 -- --
testis 55 / 143630 101 / 100058 -- 18 / 12372003 55 / 143630 101 / 100058 -- 18 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   21 / 32606     0 / 11737 21 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 166 / 207932 144 / 479819     166 / 207932 144 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 20 / 38063 52 / 133582 7 / 10193077 -- 20 / 38063 52 / 133582 7 / 10193077 --
vascular 34 / 46250 -- 2 / 13135050 -- 34 / 46250 -- 2 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --