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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.591992Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 200 / 3316537 58 / 2498449 2232 / 114162531 533 / 109592465 200 / 3316537 58 / 2498449 2232 / 114162531 533 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 2 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow       25 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 25 / 4978364
brain 89 / 506301 6 / 200215 44 / 729526 35 / 4997811 89 / 506301 6 / 200215 44 / 729526 35 / 4997811
cartilage     -- 10 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 20 / 90353   4 / 90885 5 / 1495938 20 / 90353 0 / 0 4 / 90885 5 / 1495938
cerebrum 26 / 198932   -- -- 26 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 2 / 44577 -- -- 1 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 4 / 151167 5 / 98089 6 / 643586 1 / 26551 4 / 151167 5 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 81 / 12434232 8 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 81 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442     -- 1 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 1 / 89898 2 / 155372   1 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 1 / 107249   2 / 214987 3 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 2 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 2 / 159059 2 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 2 / 159059
lymph node     21 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 21 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 8 / 104307 1908 / 43166038 226 / 30312656 8 / 46553 8 / 104307 1908 / 43166038 226 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988   1 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   1 / 74930 3 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 3 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 5 / 241088     -- 5 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 3 / 107080   9 / 491794 2 / 79993 3 / 107080 0 / 266949 9 / 491794
retina   -- 7 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 3 / 125377 91 / 26905847 92 / 34522313 1 / 73633 3 / 125377 91 / 26905847 92 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 15 / 6230144 -- -- -- 15 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 3 / 65644   2 / 448716 1 / 26641 3 / 65644 0 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   1 / 100058 -- 31 / 12372003 0 / 143630 1 / 100058 -- 31 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 13 / 479819     4 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 2 / 133582 66 / 10193077 -- 3 / 38063 2 / 133582 66 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 61 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 61 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --