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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.591767Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 160 / 3316537 77 / 2498449 745 / 114162531 1465 / 109592465 160 / 3316537 77 / 2498449 745 / 114162531 1465 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   7 / 29891 4 / 5047110 18 / 4978364 0 / 14774 7 / 29891 4 / 5047110 18 / 4978364
brain 5 / 506301 4 / 200215 6 / 729526 70 / 4997811 5 / 506301 4 / 200215 6 / 729526 70 / 4997811
cartilage     -- 3 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum     2 / 90885 24 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 24 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   2 / 85898 179 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 179 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 4 / 89898     1 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 4 / 107249   5 / 214987 3 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 5 / 214987
lung 6 / 128150 1 / 170663 1 / 159917   6 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node 9 / 62650 1 / 27007 103 / 5278419 115 / 4863489 9 / 62650 1 / 27007 103 / 5278419 115 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 1 / 104307 26 / 43166038 438 / 30312656 3 / 46553 1 / 104307 26 / 43166038 438 / 30312656
muscle 3 / 74039 1 / 27691     3 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       2 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas     1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 15 / 96524   -- -- 15 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088   1 / 207348 -- 12 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   17 / 107080 2 / 266949 4 / 491794 0 / 79993 17 / 107080 2 / 266949 4 / 491794
retina   -- 13 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 13 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 151 / 26905847 154 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 151 / 26905847 154 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 148 / 6230144 -- -- -- 148 / 6230144 --
stomach       2 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 58 / 143630 13 / 100058 -- 444 / 12372003 58 / 143630 13 / 100058 -- 444 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 1 / 115938   0 / 11737 2 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 11 / 479819   4 / 51729 2 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 8 / 38063 4 / 133582 146 / 10193077 -- 8 / 38063 4 / 133582 146 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 136 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 136 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --