Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.588854Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 38 / 3316537 19 / 2498449 91 / 114162531 124 / 109592465 38 / 3316537 19 / 2498449 91 / 114162531 124 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774       1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 3 / 506301 2 / 200215 1 / 729526 5 / 4997811 3 / 506301 2 / 200215 1 / 729526 5 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum         0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   1 / 151167   3 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043 1 / 38 -- -- 3 / 246043 1 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       10 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 10 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney     1 / 155372   0 / 106627 0 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   1 / 170663 1 / 159917   0 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node 2 / 62650   1 / 5278419   2 / 62650 0 / 27007 1 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     12 / 43166038 46 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 12 / 43166038 46 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088     -- 6 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080   2 / 491794 1 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina 2 / 29438 --     2 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 2 / 73633   20 / 26905847 47 / 34522313 2 / 73633 0 / 125377 20 / 26905847 47 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 12 / 6230144 -- -- -- 12 / 6230144 --
stomach 4 / 26641       4 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 10 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 10 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 5 / 479819     2 / 207932 5 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   2 / 133582 2 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 2 / 10193077 --
vascular   -- 36 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 36 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --