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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.584862Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 80 / 3316537 41 / 2498449 1007 / 114162531 456 / 109592465 80 / 3316537 41 / 2498449 1007 / 114162531 456 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   -- 1 / 83577 2 / 16077 0 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     21 / 5047110 57 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 21 / 5047110 57 / 4978364
brain 12 / 506301 3 / 200215 8 / 729526 58 / 4997811 12 / 506301 3 / 200215 8 / 729526 58 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 9 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 9 / 778035
cerebellum 2 / 90353     13 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 13 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888   -- -- 1 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       2 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 1 / 46440 1 / 85898   3 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 7 / 76442     -- 7 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627 4 / 89898   2 / 100281 1 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver       2 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 3 / 128150 2 / 170663     3 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650 4 / 27007 31 / 5278419   1 / 62650 4 / 27007 31 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 1 / 44303 -- -- 1 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 802 / 43166038 179 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 802 / 43166038 179 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 3 / 179472
pancreas   1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 3 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 5 / 241088   4 / 207348 -- 5 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 12 / 276455   -- -- 12 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080   2 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 0 / 266949 2 / 491794
retina   -- 22 / 820326   0 / 29438 -- 22 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 47 / 26905847 96 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 47 / 26905847 96 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 13 / 6230144 -- -- -- 13 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   7 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 1 / 100058 -- 23 / 12372003 8 / 143630 1 / 100058 -- 23 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 1 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 4 / 479819     4 / 207932 4 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   9 / 133582 21 / 10193077 -- 0 / 38063 9 / 133582 21 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 16 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 16 / 13135050 --
white blood cells -- -- 12 / 846268 -- -- -- 12 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --