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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.584760Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 115 / 3316537 31 / 2498449 841 / 114162531 5363 / 109592465 115 / 3316537 31 / 2498449 841 / 114162531 5363 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow       18 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 18 / 4978364
brain 66 / 506301 4 / 200215 121 / 729526 133 / 4997811 66 / 506301 4 / 200215 121 / 729526 133 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 14 / 90353   5 / 90885 40 / 1495938 14 / 90353 0 / 0 5 / 90885 40 / 1495938
cerebrum 17 / 198932   -- -- 17 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       7 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 7 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 1 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 4727 / 12434232 1 / 128826 4 / 46440 4 / 85898 4727 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898     0 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249     0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 1 / 128150 1 / 170663     1 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650   18 / 5278419 4 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 18 / 5278419 4 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 155 / 43166038 84 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 155 / 43166038 84 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462       1 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas     1 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 2 / 30072 -- -- 1 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   1 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     3 / 266949 10 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 10 / 491794
retina 3 / 29438 -- 69 / 820326 7 / 88490 3 / 29438 -- 69 / 820326 7 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     154 / 26905847 295 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 154 / 26905847 295 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 81 / 6230144 -- -- -- 81 / 6230144 --
stomach       3 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 2 / 100058 -- 34 / 12372003 1 / 143630 2 / 100058 -- 34 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   11 / 479819     0 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     142 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 142 / 10193077 --
vascular   -- 81 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 81 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --