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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.568046Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 33 / 3316537 23 / 2498449 1231 / 114162531 1251 / 109592465 33 / 3316537 23 / 2498449 1231 / 114162531 1251 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 15 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 15 / 4978364
brain 1 / 506301 4 / 200215 22 / 729526 234 / 4997811 1 / 506301 4 / 200215 22 / 729526 234 / 4997811
cartilage     -- 29 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 29 / 778035
cerebellum       63 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 63 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   3 / 151167 3 / 98089 8 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 3 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826   6 / 85898 97 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 6 / 85898 97 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 2 / 76442   20 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 20 / 83063 --
kidney   1 / 89898 5 / 155372 5 / 100281 0 / 106627 1 / 89898 5 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   14 / 66308 1 / 214987 1 / 96846 0 / 107249 14 / 66308 1 / 214987
lung 2 / 128150 2 / 170663 4 / 159917 11 / 159059 2 / 128150 2 / 170663 4 / 159917 11 / 159059
lymph node     46 / 5278419 26 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 46 / 5278419 26 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     540 / 43166038 353 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 540 / 43166038 353 / 30312656
muscle 5 / 74039   11 / 107836   5 / 74039 0 / 27691 11 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 1 / 94887 7 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 7 / 179472
pancreas   2 / 74930 3 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 3 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088   6 / 207348 -- 2 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080 12 / 266949 29 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 12 / 266949 29 / 491794
retina   -- 28 / 820326   0 / 29438 -- 28 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 1 / 125377 296 / 26905847 275 / 34522313 6 / 73633 1 / 125377 296 / 26905847 275 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 18 / 6230144 -- -- -- 18 / 6230144 --
stomach     1 / 124767 17 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 17 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 64 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 64 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     7 / 115938 9 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 7 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 2 / 479819 1 / 21833 6 / 51729 1 / 207932 2 / 479819 1 / 21833 6 / 51729
uterus 2 / 38063   134 / 10193077 -- 2 / 38063 0 / 133582 134 / 10193077 --
vascular   -- 41 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 41 / 13135050 --
white blood cells -- -- 7 / 846268 -- -- -- 7 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --