Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.567424Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 260 / 3316537 75 / 2498449 276 / 114162531 224 / 109592465 260 / 3316537 75 / 2498449 276 / 114162531 224 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891   2 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 0 / 5047110 2 / 4978364
brain 102 / 506301 31 / 200215 138 / 729526 99 / 4997811 102 / 506301 31 / 200215 138 / 729526 99 / 4997811
cartilage     -- 2 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 33 / 90353   12 / 90885 3 / 1495938 33 / 90353 0 / 0 12 / 90885 3 / 1495938
cerebrum 94 / 198932   -- -- 94 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   6 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 16 / 128826   2 / 85898 93 / 12434232 16 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 93 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898     0 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung         0 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     11 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 11 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 25 / 43166038 17 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 25 / 43166038 17 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988     0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas       1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 15 / 30072 -- -- 1 / 96524 15 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080 1 / 266949   1 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 0 / 491794
retina 4 / 29438 -- 65 / 820326   4 / 29438 -- 65 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     11 / 26905847 4 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 11 / 26905847 4 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4 / 6230144 -- -- -- 4 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 1 / 100058 -- 1 / 12372003 2 / 143630 1 / 100058 -- 1 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 14 / 479819     1 / 207932 14 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     3 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 3 / 10193077 --
vascular   -- 3 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 3 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --