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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.561064Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 606 / 3316537 377 / 2498449 23062 / 114162531 18342 / 109592465 606 / 3316537 377 / 2498449 23062 / 114162531 18342 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 12 / 57865 -- 9 / 83577 2 / 16077 12 / 57865 -- 9 / 83577
bone marrow 1 / 14774   134 / 5047110 67 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 134 / 5047110 67 / 4978364
brain 116 / 506301 40 / 200215 79 / 729526 706 / 4997811 116 / 506301 40 / 200215 79 / 729526 706 / 4997811
cartilage 7 / 15965 9 / 37226 -- 200 / 778035 7 / 15965 9 / 37226 -- 200 / 778035
cerebellum 9 / 90353   6 / 90885 130 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 6 / 90885 130 / 1495938
cerebrum 10 / 198932   -- -- 10 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 10 / 44577 -- -- 1 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 12 / 151167 4 / 98089 46 / 643586 3 / 26551 12 / 151167 4 / 98089 46 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 37 / 246043   -- -- 37 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 12 / 19564   -- -- 12 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 20 / 128826 3 / 46440 2 / 85898 2982 / 12434232 20 / 128826 3 / 46440 2 / 85898 2982 / 12434232
gastrointestinal tract 35 / 28803 1 / 12721 3 / 45908 -- 35 / 28803 1 / 12721 3 / 45908 --
heart 16 / 76442   7 / 83063 -- 16 / 76442 0 / 1 7 / 83063 --
kidney 10 / 106627 8 / 89898 36 / 155372 8 / 100281 10 / 106627 8 / 89898 36 / 155372 8 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 31 / 96846 31 / 107249 12 / 66308 13 / 214987 31 / 96846 31 / 107249 12 / 66308 13 / 214987
lung 15 / 128150 12 / 170663 19 / 159917 7 / 159059 15 / 128150 12 / 170663 19 / 159917 7 / 159059
lymph node 5 / 62650   2612 / 5278419 338 / 4863489 5 / 62650 0 / 27007 2612 / 5278419 338 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 12 / 104307 2608 / 43166038 4378 / 30312656 2 / 46553 12 / 104307 2608 / 43166038 4378 / 30312656
muscle 6 / 74039   3 / 107836 7 / 61270 6 / 74039 0 / 27691 3 / 107836 7 / 61270
nervous 8 / 10333   -- -- 8 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 10 / 89988 8 / 94887 14 / 179472 2 / 11462 10 / 89988 8 / 94887 14 / 179472
pancreas   8 / 74930 1 / 85728 17 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 1 / 85728 17 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 6 / 30072 -- -- 4 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 6 / 14891   -- -- 6 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 77 / 241088 4 / 39531 17 / 207348 -- 77 / 241088 4 / 39531 17 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 18 / 79993 10 / 107080 36 / 266949 29 / 491794 18 / 79993 10 / 107080 36 / 266949 29 / 491794
retina 3 / 29438 -- 90 / 820326 17 / 88490 3 / 29438 -- 90 / 820326 17 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 19 / 73633 26 / 125377 8124 / 26905847 8102 / 34522313 19 / 73633 26 / 125377 8124 / 26905847 8102 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1183 / 6230144 -- -- -- 1183 / 6230144 --
stomach 9 / 26641 7 / 65644 1 / 124767 35 / 448716 9 / 26641 7 / 65644 1 / 124767 35 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 52 / 143630 5 / 100058 -- 1224 / 12372003 52 / 143630 5 / 100058 -- 1224 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 1 / 32606 15 / 115938 9 / 124664 1 / 11737 1 / 32606 15 / 115938 9 / 124664
uncharacterized tissue 20 / 207932 124 / 479819   4 / 51729 20 / 207932 124 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 4 / 38063 23 / 133582 1438 / 10193077 -- 4 / 38063 23 / 133582 1438 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 6546 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 6546 / 13135050 --
white blood cells -- -- 78 / 846268 -- -- -- 78 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --