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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.558396Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1383 / 3316537 1432 / 2498449 2203 / 114162531 5666 / 109592465 1383 / 3316537 1432 / 2498449 2203 / 114162531 5666 / 109592465
adrenal cortex -- 8 / 9928 -- -- -- 8 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 7 / 16077 25 / 57865 -- 1 / 83577 7 / 16077 25 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow   2 / 29891 37 / 5047110 92 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 37 / 5047110 92 / 4978364
brain 367 / 506301 88 / 200215 55 / 729526 436 / 4997811 367 / 506301 88 / 200215 55 / 729526 436 / 4997811
cartilage 1 / 15965 15 / 37226 -- 17 / 778035 1 / 15965 15 / 37226 -- 17 / 778035
cerebellum 87 / 90353   4 / 90885 24 / 1495938 87 / 90353 0 / 0 4 / 90885 24 / 1495938
cerebrum 323 / 198932 2 / 3422 -- -- 323 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix   30 / 44577 -- -- 0 / 3888 30 / 44577 -- --
colon 9 / 26551 78 / 151167   35 / 643586 9 / 26551 78 / 151167 0 / 98089 35 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 100 / 246043   -- -- 100 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564   -- -- 5 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 47 / 128826 19 / 46440 1 / 85898 273 / 12434232 47 / 128826 19 / 46440 1 / 85898 273 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 28 / 12721   -- 2 / 28803 28 / 12721 0 / 45908 --
heart 20 / 76442   1 / 83063 -- 20 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 1 / 106627 52 / 89898 2 / 155372   1 / 106627 52 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 23 / 96846 128 / 107249 2 / 66308 2 / 214987 23 / 96846 128 / 107249 2 / 66308 2 / 214987
lung 23 / 128150 44 / 170663 14 / 159917 2 / 159059 23 / 128150 44 / 170663 14 / 159917 2 / 159059
lymph node 1 / 62650 4 / 27007 25 / 5278419 11 / 4863489 1 / 62650 4 / 27007 25 / 5278419 11 / 4863489
lymphoreticular   41 / 44303 -- -- 0 / 17836 41 / 44303 -- --
mammary gland 17 / 46553 208 / 104307 504 / 43166038 541 / 30312656 17 / 46553 208 / 104307 504 / 43166038 541 / 30312656
muscle 23 / 74039 39 / 27691   2 / 61270 23 / 74039 39 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous 7 / 10333   -- -- 7 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 77 / 89988 3 / 94887 5 / 179472 2 / 11462 77 / 89988 3 / 94887 5 / 179472
pancreas   77 / 74930 3 / 85728 11 / 189999 0 / 7237 77 / 74930 3 / 85728 11 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   10 / 20557 -- -- 0 / 24 10 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 48 / 39531 1 / 207348 -- 2 / 241088 48 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 87 / 276455   -- -- 87 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 77 / 107080 6 / 266949 13 / 491794 12 / 79993 77 / 107080 6 / 266949 13 / 491794
retina 3 / 29438 -- 6 / 820326 1 / 88490 3 / 29438 -- 6 / 820326 1 / 88490
salivary gland 1 / 2490 2 / 10368 -- -- 1 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 26 / 73633 65 / 125377 569 / 26905847 1163 / 34522313 26 / 73633 65 / 125377 569 / 26905847 1163 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 707 / 6230144 -- -- -- 707 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 21 / 65644   11 / 448716 2 / 26641 21 / 65644 0 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 15 / 143630 85 / 100058 -- 3026 / 12372003 15 / 143630 85 / 100058 -- 3026 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606     0 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 47 / 207932 115 / 479819     47 / 207932 115 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 38 / 133582 107 / 10193077 -- 3 / 38063 38 / 133582 107 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 148 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 148 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --