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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.55781Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 61 / 3316537 50 / 2498449 1029 / 114162531 438 / 109592465 61 / 3316537 50 / 2498449 1029 / 114162531 438 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 2 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 1 / 14774       1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 6 / 506301   36 / 729526 46 / 4997811 6 / 506301 0 / 200215 36 / 729526 46 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum     2 / 90885 4 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   8 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826   2 / 85898 24 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 24 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 5 / 89898   1 / 100281 3 / 106627 5 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   3 / 107249     0 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150 2 / 170663 2 / 159917 3 / 159059 3 / 128150 2 / 170663 2 / 159917 3 / 159059
lymph node 2 / 62650 2 / 27007 63 / 5278419   2 / 62650 2 / 27007 63 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   5 / 44303 -- -- 0 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 580 / 43166038 179 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 580 / 43166038 179 / 30312656
muscle 3 / 74039       3 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462   2 / 94887 2 / 179472 2 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 2 / 179472
pancreas     2 / 85728 1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 2 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 1 / 39531   -- 3 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 9 / 276455   -- -- 9 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 5 / 107080 1 / 266949 8 / 491794 3 / 79993 5 / 107080 1 / 266949 8 / 491794
retina   -- 24 / 820326   0 / 29438 -- 24 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 5 / 125377 134 / 26905847 139 / 34522313 3 / 73633 5 / 125377 134 / 26905847 139 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 27 / 6230144 -- -- -- 27 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 14 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 14 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737       2 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 11 / 479819     3 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 5 / 38063 2 / 133582 79 / 10193077 -- 5 / 38063 2 / 133582 79 / 10193077 --
vascular   -- 63 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 63 / 13135050 --
white blood cells -- -- 12 / 846268 -- -- -- 12 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --