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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.55378Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2 / 3316537 6 / 2498449 1299 / 114162531 1852 / 109592465 2 / 3316537 6 / 2498449 1299 / 114162531 1852 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     85 / 5047110 108 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 85 / 5047110 108 / 4978364
brain     11 / 729526 63 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 11 / 729526 63 / 4997811
cartilage     -- 8 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum     1 / 90885 33 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 33 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089 8 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 8 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye     5 / 85898 379 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 5 / 85898 379 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney     5 / 155372   0 / 106627 0 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     1 / 66308 4 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung     3 / 159917   0 / 128150 0 / 170663 3 / 159917 0 / 159059
lymph node     58 / 5278419 22 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 58 / 5278419 22 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     277 / 43166038 443 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 277 / 43166038 443 / 30312656
muscle     2 / 107836   0 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     1 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 4 / 179472
pancreas       2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     2 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     9 / 266949 18 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 9 / 266949 18 / 491794
retina   -- 12 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 12 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 260 / 26905847 473 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 260 / 26905847 473 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 130 / 6230144 -- -- -- 130 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 9 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 276 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 276 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue   2 / 479819 1 / 21833   0 / 207932 2 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus     132 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 132 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 283 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 283 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --