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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.547779Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 35 / 3316537 24 / 2498449 2080 / 114162531 4283 / 109592465 35 / 3316537 24 / 2498449 2080 / 114162531 4283 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     33 / 5047110 21 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 33 / 5047110 21 / 4978364
brain 5 / 506301   9 / 729526 146 / 4997811 5 / 506301 0 / 200215 9 / 729526 146 / 4997811
cartilage     -- 8 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum     1 / 90885 62 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 62 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   2 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye   1 / 46440 2 / 85898 612 / 12434232 0 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 612 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 4 / 106627 1 / 89898     4 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   1 / 66308 4 / 214987 1 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 6 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 2 / 159059 6 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 2 / 159059
lymph node 2 / 62650   105 / 5278419 22 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 105 / 5278419 22 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     31 / 43166038 698 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 31 / 43166038 698 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     2 / 94887   0 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 0 / 179472
pancreas       1 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524   -- -- 8 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     4 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 2 / 276455   -- -- 2 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 2 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 2 / 491794
retina   -- 13 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 13 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     1129 / 26905847 2076 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 1129 / 26905847 2076 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 179 / 6230144 -- -- -- 179 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 1 / 124767 1 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 1 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 1 / 100058 -- 617 / 12372003 2 / 143630 1 / 100058 -- 617 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 5 / 115938 7 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 7 / 124664
uncharacterized tissue   11 / 479819     0 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   2 / 133582 182 / 10193077 -- 0 / 38063 2 / 133582 182 / 10193077 --
vascular   -- 370 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 370 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --