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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.546287Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 477 / 3316537 497 / 2498449 61449 / 114162531 46785 / 109592465 477 / 3316537 497 / 2498449 61449 / 114162531 46785 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 6 / 57865 -- 53 / 83577 2 / 16077 6 / 57865 -- 53 / 83577
bone marrow 4 / 14774 17 / 29891 3333 / 5047110 3064 / 4978364 4 / 14774 17 / 29891 3333 / 5047110 3064 / 4978364
brain 24 / 506301 22 / 200215 185 / 729526 2191 / 4997811 24 / 506301 22 / 200215 185 / 729526 2191 / 4997811
cartilage 2 / 15965   -- 401 / 778035 2 / 15965 0 / 37226 -- 401 / 778035
cerebellum 5 / 90353   31 / 90885 765 / 1495938 5 / 90353 0 / 0 31 / 90885 765 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon   38 / 151167 6 / 98089 221 / 643586 0 / 26551 38 / 151167 6 / 98089 221 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 78 / 246043   -- -- 78 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 5 / 19564   -- -- 5 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 24 / 128826 5 / 46440 46 / 85898 7404 / 12434232 24 / 128826 5 / 46440 46 / 85898 7404 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 3 / 12721 17 / 45908 -- 3 / 28803 3 / 12721 17 / 45908 --
heart 17 / 76442   28 / 83063 -- 17 / 76442 0 / 1 28 / 83063 --
kidney 21 / 106627 7 / 89898 93 / 155372 58 / 100281 21 / 106627 7 / 89898 93 / 155372 58 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 26 / 107249 15 / 66308 97 / 214987 13 / 96846 26 / 107249 15 / 66308 97 / 214987
lung 22 / 128150 25 / 170663 81 / 159917 63 / 159059 22 / 128150 25 / 170663 81 / 159917 63 / 159059
lymph node 11 / 62650 21 / 27007 5316 / 5278419 7580 / 4863489 11 / 62650 21 / 27007 5316 / 5278419 7580 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 6 / 44303 -- -- 5 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland   10 / 104307 29086 / 43166038 8502 / 30312656 0 / 46553 10 / 104307 29086 / 43166038 8502 / 30312656
muscle 2 / 74039 9 / 27691 19 / 107836 49 / 61270 2 / 74039 9 / 27691 19 / 107836 49 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 17 / 89988 25 / 94887 56 / 179472 1 / 11462 17 / 89988 25 / 94887 56 / 179472
pancreas 2 / 7237 11 / 74930 29 / 85728 120 / 189999 2 / 7237 11 / 74930 29 / 85728 120 / 189999
pancreatic islet 19 / 96524 4 / 30072 -- -- 19 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 17 / 241088 5 / 39531 69 / 207348 -- 17 / 241088 5 / 39531 69 / 207348 --
pooled tissue 58 / 276455   -- -- 58 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 48 / 107080 207 / 266949 342 / 491794 8 / 79993 48 / 107080 207 / 266949 342 / 491794
retina 7 / 29438 -- 210 / 820326 34 / 88490 7 / 29438 -- 210 / 820326 34 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 23 / 125377 5709 / 26905847 4780 / 34522313 7 / 73633 23 / 125377 5709 / 26905847 4780 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 9 / 52939   -- -- 9 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4321 / 6230144 -- -- -- 4321 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 17 / 65644 44 / 124767 233 / 448716 4 / 26641 17 / 65644 44 / 124767 233 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 22 / 100058 -- 10701 / 12372003 10 / 143630 22 / 100058 -- 10701 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606 44 / 115938 41 / 124664 1 / 11737 2 / 32606 44 / 115938 41 / 124664
uncharacterized tissue 58 / 207932 111 / 479819 7 / 21833 30 / 51729 58 / 207932 111 / 479819 7 / 21833 30 / 51729
uterus 4 / 38063 33 / 133582 8635 / 10193077 -- 4 / 38063 33 / 133582 8635 / 10193077 --
vascular 9 / 46250 -- 3347 / 13135050 -- 9 / 46250 -- 3347 / 13135050 --
white blood cells -- -- 546 / 846268 -- -- -- 546 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --