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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.544577Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 4240 / 3316537 11782 / 2498449 371506 / 114162531 674864 / 109592465 4240 / 3316537 11782 / 2498449 371506 / 114162531 674864 / 109592465
adrenal cortex -- 66 / 9928 -- -- -- 66 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 18 / 16077 124 / 57865 -- 6 / 83577 18 / 16077 124 / 57865 -- 6 / 83577
bone marrow 18 / 14774 22 / 29891 5256 / 5047110 1877 / 4978364 18 / 14774 22 / 29891 5256 / 5047110 1877 / 4978364
brain 421 / 506301 920 / 200215 1476 / 729526 17288 / 4997811 421 / 506301 920 / 200215 1476 / 729526 17288 / 4997811
cartilage 13 / 15965 20 / 37226 -- 736 / 778035 13 / 15965 20 / 37226 -- 736 / 778035
cerebellum 36 / 90353   144 / 90885 3532 / 1495938 36 / 90353 0 / 0 144 / 90885 3532 / 1495938
cerebrum 118 / 198932 13 / 3422 -- -- 118 / 198932 13 / 3422 -- --
cervix   311 / 44577 -- -- 0 / 3888 311 / 44577 -- --
colon 23 / 26551 572 / 151167 69 / 98089 3933 / 643586 23 / 26551 572 / 151167 69 / 98089 3933 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1051 / 246043   -- -- 1051 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 9 / 19564 3 / 2857 -- -- 9 / 19564 3 / 2857 -- --
esophagus   22 / 17290 -- -- 0 / 270 22 / 17290 -- --
eye 288 / 128826 257 / 46440 72 / 85898 124912 / 12434232 288 / 128826 257 / 46440 72 / 85898 124912 / 12434232
gastrointestinal tract 12 / 28803 72 / 12721 12 / 45908 -- 12 / 28803 72 / 12721 12 / 45908 --
heart 135 / 76442   360 / 83063 -- 135 / 76442 0 / 1 360 / 83063 --
kidney 39 / 106627 439 / 89898 354 / 155372 665 / 100281 39 / 106627 439 / 89898 354 / 155372 665 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 72 / 96846 399 / 107249 113 / 66308 984 / 214987 72 / 96846 399 / 107249 113 / 66308 984 / 214987
lung 97 / 128150 1282 / 170663 548 / 159917 241 / 159059 97 / 128150 1282 / 170663 548 / 159917 241 / 159059
lymph node 71 / 62650 110 / 27007 22044 / 5278419 6773 / 4863489 71 / 62650 110 / 27007 22044 / 5278419 6773 / 4863489
lymphoreticular 191 / 17836 455 / 44303 -- -- 191 / 17836 455 / 44303 -- --
mammary gland 117 / 46553 397 / 104307 4978 / 43166038 157623 / 30312656 117 / 46553 397 / 104307 4978 / 43166038 157623 / 30312656
muscle 215 / 74039 144 / 27691 987 / 107836 107 / 61270 215 / 74039 144 / 27691 987 / 107836 107 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 6 / 11462 680 / 89988 632 / 94887 485 / 179472 6 / 11462 680 / 89988 632 / 94887 485 / 179472
pancreas 4 / 7237 401 / 74930 35 / 85728 295 / 189999 4 / 7237 401 / 74930 35 / 85728 295 / 189999
pancreatic islet 81 / 96524 26 / 30072 -- -- 81 / 96524 26 / 30072 -- --
parathyroid   15 / 20557 -- -- 0 / 24 15 / 20557 -- --
peripheral nervous system 55 / 14891   -- -- 55 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 31 / 6170 -- -- -- 31 / 6170 -- -- --
pituitary gland 23 / 13260 2 / 1358 -- -- 23 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 225 / 241088 487 / 39531 339 / 207348 -- 225 / 241088 487 / 39531 339 / 207348 --
pooled tissue 105 / 276455   -- -- 105 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 56 / 79993 388 / 107080 1289 / 266949 914 / 491794 56 / 79993 388 / 107080 1289 / 266949 914 / 491794
retina 177 / 29438 -- 4082 / 820326 732 / 88490 177 / 29438 -- 4082 / 820326 732 / 88490
salivary gland   143 / 10368 -- -- 0 / 2490 143 / 10368 -- --
skin 85 / 73633 1526 / 125377 127036 / 26905847 173500 / 34522313 85 / 73633 1526 / 125377 127036 / 26905847 173500 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 16 / 52939   -- -- 16 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 25851 / 6230144 -- -- -- 25851 / 6230144 --
stomach 13 / 26641 229 / 65644 184 / 124767 955 / 448716 13 / 26641 229 / 65644 184 / 124767 955 / 448716
synovium   12 / 1650 -- -- 0 / 249 12 / 1650 -- --
testis 64 / 143630 364 / 100058 -- 178201 / 12372003 64 / 143630 364 / 100058 -- 178201 / 12372003
thymus 2 / 4478 1 / 165 -- -- 2 / 4478 1 / 165 -- --
thyroid 11 / 11737 27 / 32606 186 / 115938 520 / 124664 11 / 11737 27 / 32606 186 / 115938 520 / 124664
uncharacterized tissue 292 / 207932 1172 / 479819 7 / 21833 585 / 51729 292 / 207932 1172 / 479819 7 / 21833 585 / 51729
uterus 15 / 38063 681 / 133582 8528 / 10193077 -- 15 / 38063 681 / 133582 8528 / 10193077 --
vascular 23 / 46250 -- 165898 / 13135050 -- 23 / 46250 -- 165898 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1026 / 846268 -- -- -- 1026 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --