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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.536158Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 37 / 3316537 46 / 2498449 8189 / 114162531 1451 / 109592465 37 / 3316537 46 / 2498449 8189 / 114162531 1451 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   -- 7 / 83577 1 / 16077 0 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow       33 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 33 / 4978364
brain 4 / 506301 4 / 200215 51 / 729526 144 / 4997811 4 / 506301 4 / 200215 51 / 729526 144 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 20 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 20 / 778035
cerebellum     3 / 90885 16 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 16 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089 11 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 11 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826   1 / 85898 92 / 12434232 4 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 92 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney     5 / 155372   0 / 106627 0 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249   2 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 4 / 128150 2 / 170663 1 / 159917 10 / 159059 4 / 128150 2 / 170663 1 / 159917 10 / 159059
lymph node   2 / 27007 153 / 5278419 8 / 4863489 0 / 62650 2 / 27007 153 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 6845 / 43166038 713 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 6845 / 43166038 713 / 30312656
muscle 1 / 74039   1 / 107836   1 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     3 / 94887 9 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 3 / 94887 9 / 179472
pancreas 1 / 7237   6 / 85728 10 / 189999 1 / 7237 0 / 74930 6 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   2 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 1 / 276455   -- -- 1 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   12 / 107080 2 / 266949 17 / 491794 0 / 79993 12 / 107080 2 / 266949 17 / 491794
retina   -- 24 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 24 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     261 / 26905847 196 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 261 / 26905847 196 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 109 / 6230144 -- -- -- 109 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 3 / 124767 11 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 3 / 124767 11 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 1 / 100058 -- 145 / 12372003 2 / 143630 1 / 100058 -- 145 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 1 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 1 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 9 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 3 / 207932 9 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 5 / 133582 527 / 10193077 -- 2 / 38063 5 / 133582 527 / 10193077 --
vascular   -- 123 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 123 / 13135050 --
white blood cells -- -- 65 / 846268 -- -- -- 65 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --