Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.534956Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 26 / 3316537 7 / 2498449 136 / 114162531 405 / 109592465 26 / 3316537 7 / 2498449 136 / 114162531 405 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     28 / 5047110 10 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 28 / 5047110 10 / 4978364
brain 4 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 77 / 4997811 4 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 77 / 4997811
cartilage   2 / 37226 --   0 / 15965 2 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 3 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 3 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826     12 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 12 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney     1 / 155372 1 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 1 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150   1 / 159917   3 / 128150 0 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node     28 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 28 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     1 / 43166038 23 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 1 / 43166038 23 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 7 / 241088     -- 7 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080     0 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     32 / 26905847 267 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 32 / 26905847 267 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630   -- 10 / 12372003 1 / 143630 0 / 100058 -- 10 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 2 / 479819     2 / 207932 2 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063   3 / 10193077 -- 1 / 38063 0 / 133582 3 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- -- 35 / 846268 -- -- -- 35 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --