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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.534385Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 76 / 3316537 83 / 2498449 615 / 114162531 1307 / 109592465 76 / 3316537 83 / 2498449 615 / 114162531 1307 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow     19 / 5047110 6 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 19 / 5047110 6 / 4978364
brain 1 / 506301 9 / 200215 6 / 729526 72 / 4997811 1 / 506301 9 / 200215 6 / 729526 72 / 4997811
cartilage     -- 7 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum       54 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 54 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   13 / 151167 1 / 98089 35 / 643586 0 / 26551 13 / 151167 1 / 98089 35 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 102 / 12434232 3 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 102 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 4 / 106627   6 / 155372 5 / 100281 4 / 106627 0 / 89898 6 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249   3 / 214987 0 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 3 / 128150 8 / 170663 1 / 159917 1 / 159059 3 / 128150 8 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node 15 / 62650   60 / 5278419 107 / 4863489 15 / 62650 0 / 27007 60 / 5278419 107 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   9 / 104307 38 / 43166038 232 / 30312656 0 / 46553 9 / 104307 38 / 43166038 232 / 30312656
muscle   1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 0 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988 4 / 94887 8 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 4 / 94887 8 / 179472
pancreas       4 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088   3 / 207348 -- 6 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 6 / 107080 8 / 266949 10 / 491794 1 / 79993 6 / 107080 8 / 266949 10 / 491794
retina   -- 7 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 7 / 820326 1 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 82 / 26905847 160 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 82 / 26905847 160 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 135 / 6230144 -- -- -- 135 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   9 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 488 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 488 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 18 / 479819 1 / 21833 1 / 51729 1 / 207932 18 / 479819 1 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 5 / 133582 52 / 10193077 -- 1 / 38063 5 / 133582 52 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 181 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 181 / 13135050 --
white blood cells -- -- 7 / 846268 -- -- -- 7 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --