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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.534350Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 233 / 3316537 286 / 2498449 5189 / 114162531 7544 / 109592465 233 / 3316537 286 / 2498449 5189 / 114162531 7544 / 109592465
adrenal cortex -- 4 / 9928 -- -- -- 4 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 8 / 57865 --   1 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891 17 / 5047110 18 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 17 / 5047110 18 / 4978364
brain 31 / 506301 17 / 200215 49 / 729526 215 / 4997811 31 / 506301 17 / 200215 49 / 729526 215 / 4997811
cartilage 1 / 15965 3 / 37226 -- 7 / 778035 1 / 15965 3 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 2 / 90353   5 / 90885 152 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 5 / 90885 152 / 1495938
cerebrum 11 / 198932   -- -- 11 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 16 / 151167   19 / 643586 2 / 26551 16 / 151167 0 / 98089 19 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 19 / 246043   -- -- 19 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 9 / 46440 1 / 85898 199 / 12434232 17 / 128826 9 / 46440 1 / 85898 199 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 6 / 76442   5 / 83063 -- 6 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 2 / 106627 1 / 89898 5 / 155372 7 / 100281 2 / 106627 1 / 89898 5 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 8 / 107249 7 / 66308 23 / 214987 1 / 96846 8 / 107249 7 / 66308 23 / 214987
lung 9 / 128150 16 / 170663 7 / 159917 6 / 159059 9 / 128150 16 / 170663 7 / 159917 6 / 159059
lymph node 4 / 62650 4 / 27007 1485 / 5278419 793 / 4863489 4 / 62650 4 / 27007 1485 / 5278419 793 / 4863489
lymphoreticular 6 / 17836 43 / 44303 -- -- 6 / 17836 43 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 9 / 104307 46 / 43166038 1283 / 30312656 6 / 46553 9 / 104307 46 / 43166038 1283 / 30312656
muscle 3 / 74039 4 / 27691 6 / 107836 4 / 61270 3 / 74039 4 / 27691 6 / 107836 4 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 6 / 179472 3 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 6 / 179472
pancreas   9 / 74930 1 / 85728 6 / 189999 0 / 7237 9 / 74930 1 / 85728 6 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 38 / 241088 8 / 39531 228 / 207348 -- 38 / 241088 8 / 39531 228 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 5 / 107080 36 / 266949 27 / 491794 7 / 79993 5 / 107080 36 / 266949 27 / 491794
retina 4 / 29438 -- 49 / 820326 3 / 88490 4 / 29438 -- 49 / 820326 3 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 5 / 125377 1977 / 26905847 1677 / 34522313 1 / 73633 5 / 125377 1977 / 26905847 1677 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 149 / 6230144 -- -- -- 149 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 6 / 65644 6 / 124767 27 / 448716 2 / 26641 6 / 65644 6 / 124767 27 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 12 / 143630 1 / 100058 -- 3060 / 12372003 12 / 143630 1 / 100058 -- 3060 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   4 / 32606 3 / 115938 7 / 124664 0 / 11737 4 / 32606 3 / 115938 7 / 124664
uncharacterized tissue 10 / 207932 74 / 479819 1 / 21833 5 / 51729 10 / 207932 74 / 479819 1 / 21833 5 / 51729
uterus 1 / 38063 14 / 133582 227 / 10193077 -- 1 / 38063 14 / 133582 227 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 846 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 846 / 13135050 --
white blood cells -- -- 31 / 846268 -- -- -- 31 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --