Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.534332Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 25 / 3316537 48 / 2498449 259 / 114162531 132 / 109592465 25 / 3316537 48 / 2498449 259 / 114162531 132 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain     1 / 729526 1 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 1 / 729526 1 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum         0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   5 / 151167     0 / 26551 5 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye         0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract     63 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 63 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney         0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   4 / 170663   17 / 159059 0 / 128150 4 / 170663 0 / 159917 17 / 159059
lymph node         0 / 62650 0 / 27007 0 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 94 / 43166038 15 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 94 / 43166038 15 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   26 / 74930   20 / 189999 0 / 7237 26 / 74930 0 / 85728 20 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       1 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin         0 / 73633 0 / 125377 0 / 26905847 0 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach 19 / 26641 12 / 65644 101 / 124767 78 / 448716 19 / 26641 12 / 65644 101 / 124767 78 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue         0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus       -- 0 / 38063 0 / 133582 0 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --