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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.533772Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 69 / 3316537 107 / 2498449 3143 / 114162531 6755 / 109592465 69 / 3316537 107 / 2498449 3143 / 114162531 6755 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     -- 18 / 83577 0 / 16077 0 / 57865 -- 18 / 83577
bone marrow     2 / 5047110 5 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 2 / 5047110 5 / 4978364
brain 10 / 506301 22 / 200215 102 / 729526 2375 / 4997811 10 / 506301 22 / 200215 102 / 729526 2375 / 4997811
cartilage     -- 56 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 56 / 778035
cerebellum     13 / 90885 131 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 13 / 90885 131 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 2 / 98089 190 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 2 / 98089 190 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826   14 / 85898 774 / 12434232 9 / 128826 0 / 46440 14 / 85898 774 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721 2 / 45908 -- 0 / 28803 2 / 12721 2 / 45908 --
heart     5 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 2 / 100281 1 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     1 / 66308 10 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 10 / 214987
lung 1 / 128150 8 / 170663 17 / 159917 34 / 159059 1 / 128150 8 / 170663 17 / 159917 34 / 159059
lymph node     55 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 55 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   6 / 104307 910 / 43166038 1815 / 30312656 0 / 46553 6 / 104307 910 / 43166038 1815 / 30312656
muscle 1 / 74039   5 / 107836 2 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 5 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988 9 / 94887 16 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 9 / 94887 16 / 179472
pancreas   5 / 74930 18 / 85728 33 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 18 / 85728 33 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   1 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 10 / 79993 6 / 107080 31 / 266949 131 / 491794 10 / 79993 6 / 107080 31 / 266949 131 / 491794
retina 5 / 29438 -- 40 / 820326 4 / 88490 5 / 29438 -- 40 / 820326 4 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin   10 / 125377 455 / 26905847 971 / 34522313 0 / 73633 10 / 125377 455 / 26905847 971 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 286 / 6230144 -- -- -- 286 / 6230144 --
stomach   9 / 65644 2 / 124767 13 / 448716 0 / 26641 9 / 65644 2 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 170 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 170 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     6 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 6 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 24 / 479819 3 / 21833   3 / 207932 24 / 479819 3 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 2 / 133582 323 / 10193077 -- 3 / 38063 2 / 133582 323 / 10193077 --
vascular   -- 829 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 829 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --