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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.533444Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 235 / 3316537 175 / 2498449 1423 / 114162531 1457 / 109592465 235 / 3316537 175 / 2498449 1423 / 114162531 1457 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 6 / 57865 -- 2 / 83577 1 / 16077 6 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 3 / 14774 1 / 29891 46 / 5047110 30 / 4978364 3 / 14774 1 / 29891 46 / 5047110 30 / 4978364
brain 20 / 506301 6 / 200215 7 / 729526 114 / 4997811 20 / 506301 6 / 200215 7 / 729526 114 / 4997811
cartilage   10 / 37226 -- 29 / 778035 0 / 15965 10 / 37226 -- 29 / 778035
cerebellum 2 / 90353   2 / 90885 29 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 2 / 90885 29 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 16 / 151167 1 / 98089 12 / 643586 5 / 26551 16 / 151167 1 / 98089 12 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 15 / 128826     44 / 12434232 15 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 44 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803   1 / 45908 -- 3 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 26 / 106627 12 / 89898 4 / 155372   26 / 106627 12 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 9 / 96846 17 / 107249 8 / 66308 3 / 214987 9 / 96846 17 / 107249 8 / 66308 3 / 214987
lung 8 / 128150 7 / 170663 3 / 159917 3 / 159059 8 / 128150 7 / 170663 3 / 159917 3 / 159059
lymph node 1 / 62650 10 / 27007 68 / 5278419 9 / 4863489 1 / 62650 10 / 27007 68 / 5278419 9 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 4 / 44303 -- -- 1 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 5 / 104307 202 / 43166038 537 / 30312656 6 / 46553 5 / 104307 202 / 43166038 537 / 30312656
muscle 4 / 74039 1 / 27691 2 / 107836   4 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 6 / 89988 1 / 94887 5 / 179472 1 / 11462 6 / 89988 1 / 94887 5 / 179472
pancreas   2 / 74930 4 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 4 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 12 / 30072 -- -- 4 / 96524 12 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088   3 / 207348 -- 20 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 36 / 276455   -- -- 36 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 1 / 107080 5 / 266949 16 / 491794 9 / 79993 1 / 107080 5 / 266949 16 / 491794
retina 3 / 29438 -- 9 / 820326 1 / 88490 3 / 29438 -- 9 / 820326 1 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 5 / 125377 489 / 26905847 492 / 34522313 3 / 73633 5 / 125377 489 / 26905847 492 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 79 / 6230144 -- -- -- 79 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 3 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 3 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 2 / 100058 -- 116 / 12372003 8 / 143630 2 / 100058 -- 116 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     3 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 25 / 207932 43 / 479819 1 / 21833   25 / 207932 43 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 2 / 133582 219 / 10193077 -- 4 / 38063 2 / 133582 219 / 10193077 --
vascular   -- 238 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 238 / 13135050 --
white blood cells -- -- 24 / 846268 -- -- -- 24 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --