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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.532359Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1387 / 3316537 1774 / 2498449 64569 / 114162531 70795 / 109592465 1387 / 3316537 1774 / 2498449 64569 / 114162531 70795 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 85 / 57865 -- 52 / 83577 2 / 16077 85 / 57865 -- 52 / 83577
bone marrow 7 / 14774 30 / 29891 7590 / 5047110 5620 / 4978364 7 / 14774 30 / 29891 7590 / 5047110 5620 / 4978364
brain 117 / 506301 67 / 200215 359 / 729526 3464 / 4997811 117 / 506301 67 / 200215 359 / 729526 3464 / 4997811
cartilage 4 / 15965 25 / 37226 -- 375 / 778035 4 / 15965 25 / 37226 -- 375 / 778035
cerebellum 13 / 90353   34 / 90885 1419 / 1495938 13 / 90353 0 / 0 34 / 90885 1419 / 1495938
cerebrum 38 / 198932   -- -- 38 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   41 / 44577 -- -- 0 / 3888 41 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 83 / 151167 24 / 98089 409 / 643586 2 / 26551 83 / 151167 24 / 98089 409 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 235 / 246043   -- -- 235 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 56 / 128826 75 / 46440 61 / 85898 9878 / 12434232 56 / 128826 75 / 46440 61 / 85898 9878 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 13 / 12721 22 / 45908 -- 4 / 28803 13 / 12721 22 / 45908 --
heart 29 / 76442   38 / 83063 -- 29 / 76442 0 / 1 38 / 83063 --
kidney 49 / 106627 62 / 89898 105 / 155372 49 / 100281 49 / 106627 62 / 89898 105 / 155372 49 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 33 / 96846 163 / 107249 14 / 66308 140 / 214987 33 / 96846 163 / 107249 14 / 66308 140 / 214987
lung 48 / 128150 122 / 170663 120 / 159917 117 / 159059 48 / 128150 122 / 170663 120 / 159917 117 / 159059
lymph node 8 / 62650 30 / 27007 4886 / 5278419 11599 / 4863489 8 / 62650 30 / 27007 4886 / 5278419 11599 / 4863489
lymphoreticular 39 / 17836 61 / 44303 -- -- 39 / 17836 61 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 62 / 104307 4464 / 43166038 15279 / 30312656 3 / 46553 62 / 104307 4464 / 43166038 15279 / 30312656
muscle 31 / 74039 54 / 27691 31 / 107836 61 / 61270 31 / 74039 54 / 27691 31 / 107836 61 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 13 / 11462 52 / 89988 45 / 94887 128 / 179472 13 / 11462 52 / 89988 45 / 94887 128 / 179472
pancreas 17 / 7237 29 / 74930 95 / 85728 115 / 189999 17 / 7237 29 / 74930 95 / 85728 115 / 189999
pancreatic islet 148 / 96524 16 / 30072 -- -- 148 / 96524 16 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 8 / 14891   -- -- 8 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 19 / 13260 1 / 1358 -- -- 19 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088 64 / 39531 71 / 207348 -- 23 / 241088 64 / 39531 71 / 207348 --
pooled tissue 83 / 276455   -- -- 83 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 25 / 79993 49 / 107080 213 / 266949 304 / 491794 25 / 79993 49 / 107080 213 / 266949 304 / 491794
retina 10 / 29438 -- 114 / 820326 58 / 88490 10 / 29438 -- 114 / 820326 58 / 88490
salivary gland 1 / 2490 4 / 10368 -- -- 1 / 2490 4 / 10368 -- --
skin 19 / 73633 93 / 125377 14864 / 26905847 5705 / 34522313 19 / 73633 93 / 125377 14864 / 26905847 5705 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 31 / 52939   -- -- 31 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5866 / 6230144 -- -- -- 5866 / 6230144 --
stomach 19 / 26641 97 / 65644 93 / 124767 221 / 448716 19 / 26641 97 / 65644 93 / 124767 221 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 49 / 100058 -- 15683 / 12372003 14 / 143630 49 / 100058 -- 15683 / 12372003
thymus 4 / 4478   -- -- 4 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 11 / 11737 15 / 32606 113 / 115938 79 / 124664 11 / 11737 15 / 32606 113 / 115938 79 / 124664
uncharacterized tissue 156 / 207932 202 / 479819 9 / 21833 40 / 51729 156 / 207932 202 / 479819 9 / 21833 40 / 51729
uterus 17 / 38063 121 / 133582 19540 / 10193077 -- 17 / 38063 121 / 133582 19540 / 10193077 --
vascular 30 / 46250 -- 5269 / 13135050 -- 30 / 46250 -- 5269 / 13135050 --
white blood cells -- -- 529 / 846268 -- -- -- 529 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --