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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.531668Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 158 / 3316537 61 / 2498449 4552 / 114162531 4865 / 109592465 158 / 3316537 61 / 2498449 4552 / 114162531 4865 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 55 / 506301 16 / 200215 27 / 729526 210 / 4997811 55 / 506301 16 / 200215 27 / 729526 210 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum     2 / 90885 11 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 11 / 1495938
cerebrum 24 / 198932   -- -- 24 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 1 / 46440   548 / 12434232 9 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 548 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   2 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 2 / 106627 7 / 89898 10 / 155372   2 / 106627 7 / 89898 10 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 2 / 107249   1 / 214987 5 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 14 / 128150 8 / 170663 9 / 159917 6 / 159059 14 / 128150 8 / 170663 9 / 159917 6 / 159059
lymph node     4 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 4 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 8 / 46553 1 / 104307 3083 / 43166038 2144 / 30312656 8 / 46553 1 / 104307 3083 / 43166038 2144 / 30312656
muscle 1 / 74039     4 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 4 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       4 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 4 / 179472
pancreas   1 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088 1 / 39531   -- 6 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 1 / 107080 9 / 266949 3 / 491794 5 / 79993 1 / 107080 9 / 266949 3 / 491794
retina   -- 18 / 820326   0 / 29438 -- 18 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 1179 / 26905847 1886 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 1179 / 26905847 1886 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 5 / 6230144 -- -- -- 5 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 3 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 3 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 1 / 100058 -- 33 / 12372003 2 / 143630 1 / 100058 -- 33 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     5 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 8 / 479819     2 / 207932 8 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   5 / 133582 143 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 143 / 10193077 --
vascular   -- 48 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 48 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --