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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.531563Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 41 / 3316537 83 / 2498449 899 / 114162531 1863 / 109592465 41 / 3316537 83 / 2498449 899 / 114162531 1863 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 3 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 3 / 4978364
brain 10 / 506301 17 / 200215 12 / 729526 185 / 4997811 10 / 506301 17 / 200215 12 / 729526 185 / 4997811
cartilage     -- 18 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 18 / 778035
cerebellum       30 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 30 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 6 / 151167   6 / 643586 1 / 26551 6 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye   4 / 46440 2 / 85898 194 / 12434232 0 / 128826 4 / 46440 2 / 85898 194 / 12434232
gastrointestinal tract   2 / 12721   -- 0 / 28803 2 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 2 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 7 / 100281 2 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249   3 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 2 / 128150 2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059 2 / 128150 2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059
lymph node     44 / 5278419 10 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 44 / 5278419 10 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836   -- -- 2 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   5 / 104307 68 / 43166038 260 / 30312656 0 / 46553 5 / 104307 68 / 43166038 260 / 30312656
muscle 3 / 74039 6 / 27691   1 / 61270 3 / 74039 6 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   10 / 89988 2 / 94887   0 / 11462 10 / 89988 2 / 94887 0 / 179472
pancreas 1 / 7237 7 / 74930 2 / 85728   1 / 7237 7 / 74930 2 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088 2 / 39531 11 / 207348 -- 9 / 241088 2 / 39531 11 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080 8 / 266949 23 / 491794 1 / 79993 1 / 107080 8 / 266949 23 / 491794
retina   -- 14 / 820326 5 / 88490 0 / 29438 -- 14 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 247 / 26905847 735 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 247 / 26905847 735 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 93 / 6230144 -- -- -- 93 / 6230144 --
stomach     4 / 124767 6 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 4 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630   -- 373 / 12372003 4 / 143630 0 / 100058 -- 373 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue   12 / 479819     0 / 207932 12 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     117 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 117 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 260 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 260 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --