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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.530436Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 160 / 3316537 99 / 2498449 6091 / 114162531 6971 / 109592465 160 / 3316537 99 / 2498449 6091 / 114162531 6971 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 2 / 29891 121 / 5047110 30 / 4978364 1 / 14774 2 / 29891 121 / 5047110 30 / 4978364
brain 39 / 506301 5 / 200215 34 / 729526 357 / 4997811 39 / 506301 5 / 200215 34 / 729526 357 / 4997811
cartilage 2 / 15965 2 / 37226 -- 19 / 778035 2 / 15965 2 / 37226 -- 19 / 778035
cerebellum 1 / 90353   9 / 90885 52 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 9 / 90885 52 / 1495938
cerebrum 18 / 198932   -- -- 18 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   5 / 151167 2 / 98089 6 / 643586 0 / 26551 5 / 151167 2 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 9 / 246043   -- -- 9 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 669 / 12434232 5 / 128826 1 / 46440 1 / 85898 669 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   8 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 8 / 83063 --
kidney 8 / 106627 8 / 89898 4 / 155372   8 / 106627 8 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 3 / 107249   12 / 214987 10 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 12 / 214987
lung 5 / 128150   7 / 159917 2 / 159059 5 / 128150 0 / 170663 7 / 159917 2 / 159059
lymph node 2 / 62650 2 / 27007 326 / 5278419 224 / 4863489 2 / 62650 2 / 27007 326 / 5278419 224 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 3 / 104307 71 / 43166038 1588 / 30312656 6 / 46553 3 / 104307 71 / 43166038 1588 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836 1 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 5 / 89988 6 / 94887 5 / 179472 1 / 11462 5 / 89988 6 / 94887 5 / 179472
pancreas   2 / 74930 2 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 2 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524 2 / 30072 -- -- 7 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088   27 / 207348 -- 4 / 241088 0 / 39531 27 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   9 / 107080 4 / 266949 13 / 491794 0 / 79993 9 / 107080 4 / 266949 13 / 491794
retina   -- 58 / 820326   0 / 29438 -- 58 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 6 / 125377 3389 / 26905847 3454 / 34522313 3 / 73633 6 / 125377 3389 / 26905847 3454 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 305 / 6230144 -- -- -- 305 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 1 / 65644 8 / 124767 30 / 448716 2 / 26641 1 / 65644 8 / 124767 30 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 6 / 100058 -- 475 / 12372003 4 / 143630 6 / 100058 -- 475 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 15 / 115938 27 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 15 / 115938 27 / 124664
uncharacterized tissue 13 / 207932 20 / 479819   3 / 51729 13 / 207932 20 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus   11 / 133582 640 / 10193077 -- 0 / 38063 11 / 133582 640 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 1026 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 1026 / 13135050 --
white blood cells -- -- 27 / 846268 -- -- -- 27 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --