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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.530402Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 174 / 3316537 328 / 2498449 1883 / 114162531 3102 / 109592465 174 / 3316537 328 / 2498449 1883 / 114162531 3102 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 10 / 57865 -- 3 / 83577 3 / 16077 10 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 12 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 12 / 4978364
brain 19 / 506301 19 / 200215 11 / 729526 87 / 4997811 19 / 506301 19 / 200215 11 / 729526 87 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 10 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 12 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 12 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 11 / 151167   6 / 643586 2 / 26551 11 / 151167 0 / 98089 6 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 8 / 46440   984 / 12434232 8 / 128826 8 / 46440 0 / 85898 984 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 9 / 76442   1 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 4 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 2 / 100281 4 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 4 / 107249   1 / 214987 2 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 13 / 128150 26 / 170663 1 / 159917 4 / 159059 13 / 128150 26 / 170663 1 / 159917 4 / 159059
lymph node 10 / 62650 1 / 27007 154 / 5278419 70 / 4863489 10 / 62650 1 / 27007 154 / 5278419 70 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 3 / 44303 -- -- 5 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 6 / 104307 238 / 43166038 633 / 30312656 3 / 46553 6 / 104307 238 / 43166038 633 / 30312656
muscle 3 / 74039 20 / 27691 3 / 107836   3 / 74039 20 / 27691 3 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   16 / 89988 2 / 94887 4 / 179472 0 / 11462 16 / 89988 2 / 94887 4 / 179472
pancreas   13 / 74930   5 / 189999 0 / 7237 13 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 13 / 241088   1 / 207348 -- 13 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 30 / 276455   -- -- 30 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   11 / 107080 4 / 266949 9 / 491794 0 / 79993 11 / 107080 4 / 266949 9 / 491794
retina 3 / 29438 -- 7 / 820326   3 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 27 / 125377 608 / 26905847 668 / 34522313 4 / 73633 27 / 125377 608 / 26905847 668 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 177 / 6230144 -- -- -- 177 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 1 / 124767 7 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 1 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 5 / 100058 -- 581 / 12372003 13 / 143630 5 / 100058 -- 581 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 4 / 32606 1 / 115938 4 / 124664 1 / 11737 4 / 32606 1 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 7 / 207932 110 / 479819     7 / 207932 110 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 14 / 133582 250 / 10193077 -- 3 / 38063 14 / 133582 250 / 10193077 --
vascular   -- 407 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 407 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --