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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.529925Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 160 / 3316537 65 / 2498449 1066 / 114162531 1131 / 109592465 160 / 3316537 65 / 2498449 1066 / 114162531 1131 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     38 / 5047110 36 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 38 / 5047110 36 / 4978364
brain 28 / 506301 2 / 200215 10 / 729526 42 / 4997811 28 / 506301 2 / 200215 10 / 729526 42 / 4997811
cartilage     -- 9 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 9 / 778035
cerebellum 3 / 90353     8 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 0 / 90885 8 / 1495938
cerebrum 5 / 198932   -- -- 5 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   9 / 151167   2 / 643586 0 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 90 / 12434232 6 / 128826 1 / 46440 3 / 85898 90 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 9 / 106627 4 / 89898     9 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 2 / 214987 3 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 2 / 214987
lung 8 / 128150 7 / 170663   1 / 159059 8 / 128150 7 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 6 / 62650   44 / 5278419 6 / 4863489 6 / 62650 0 / 27007 44 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     551 / 43166038 449 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 551 / 43166038 449 / 30312656
muscle 11 / 74039     1 / 61270 11 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   4 / 89988   6 / 179472 0 / 11462 4 / 89988 0 / 94887 6 / 179472
pancreas   4 / 74930     0 / 7237 4 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 9 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 6 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 2 / 266949 6 / 491794
retina 1 / 29438 -- 10 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 10 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633   147 / 26905847 372 / 34522313 2 / 73633 0 / 125377 147 / 26905847 372 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 30 / 6230144 -- -- -- 30 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 4 / 124767 8 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 4 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 1 / 100058 -- 91 / 12372003 3 / 143630 1 / 100058 -- 91 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 4 / 115938   0 / 11737 1 / 32606 4 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 18 / 479819   1 / 51729 9 / 207932 18 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 6 / 38063 6 / 133582 97 / 10193077 -- 6 / 38063 6 / 133582 97 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 113 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 113 / 13135050 --
white blood cells -- -- 10 / 846268 -- -- -- 10 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --