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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.529782Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1372 / 3316537 1234 / 2498449 7343 / 114162531 12749 / 109592465 1372 / 3316537 1234 / 2498449 7343 / 114162531 12749 / 109592465
adrenal cortex -- 6 / 9928 -- -- -- 6 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 11 / 16077 12 / 57865 -- 1 / 83577 11 / 16077 12 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 2 / 14774 7 / 29891 46 / 5047110 124 / 4978364 2 / 14774 7 / 29891 46 / 5047110 124 / 4978364
brain 362 / 506301 91 / 200215 78 / 729526 726 / 4997811 362 / 506301 91 / 200215 78 / 729526 726 / 4997811
cartilage 21 / 15965 15 / 37226 -- 60 / 778035 21 / 15965 15 / 37226 -- 60 / 778035
cerebellum 57 / 90353   6 / 90885 266 / 1495938 57 / 90353 0 / 0 6 / 90885 266 / 1495938
cerebrum 101 / 198932 5 / 3422 -- -- 101 / 198932 5 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 17 / 44577 -- -- 1 / 3888 17 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 53 / 151167 3 / 98089 36 / 643586 2 / 26551 53 / 151167 3 / 98089 36 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 108 / 246043   -- -- 108 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 7 / 19564 2 / 2857 -- -- 7 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 33 / 128826 17 / 46440 3 / 85898 497 / 12434232 33 / 128826 17 / 46440 3 / 85898 497 / 12434232
gastrointestinal tract 13 / 28803 12 / 12721 1 / 45908 -- 13 / 28803 12 / 12721 1 / 45908 --
heart 27 / 76442   26 / 83063 -- 27 / 76442 0 / 1 26 / 83063 --
kidney 48 / 106627 41 / 89898 17 / 155372 31 / 100281 48 / 106627 41 / 89898 17 / 155372 31 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 37 / 107249 16 / 66308 15 / 214987 10 / 96846 37 / 107249 16 / 66308 15 / 214987
lung 135 / 128150 81 / 170663 24 / 159917 6 / 159059 135 / 128150 81 / 170663 24 / 159917 6 / 159059
lymph node 14 / 62650 9 / 27007 444 / 5278419 122 / 4863489 14 / 62650 9 / 27007 444 / 5278419 122 / 4863489
lymphoreticular 6 / 17836 49 / 44303 -- -- 6 / 17836 49 / 44303 -- --
mammary gland 9 / 46553 33 / 104307 870 / 43166038 5153 / 30312656 9 / 46553 33 / 104307 870 / 43166038 5153 / 30312656
muscle 9 / 74039 7 / 27691 10 / 107836 4 / 61270 9 / 74039 7 / 27691 10 / 107836 4 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 36 / 89988 19 / 94887 17 / 179472 2 / 11462 36 / 89988 19 / 94887 17 / 179472
pancreas   34 / 74930 1 / 85728 18 / 189999 0 / 7237 34 / 74930 1 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 11 / 30072 -- -- 6 / 96524 11 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260 3 / 1358 -- -- 1 / 13260 3 / 1358 -- --
placenta 89 / 241088 61 / 39531 54 / 207348 -- 89 / 241088 61 / 39531 54 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 22 / 79993 73 / 107080 26 / 266949 83 / 491794 22 / 79993 73 / 107080 26 / 266949 83 / 491794
retina 3 / 29438 -- 92 / 820326 8 / 88490 3 / 29438 -- 92 / 820326 8 / 88490
salivary gland   4 / 10368 -- -- 0 / 2490 4 / 10368 -- --
skin 24 / 73633 61 / 125377 1542 / 26905847 1612 / 34522313 24 / 73633 61 / 125377 1542 / 26905847 1612 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 42 / 52939   -- -- 42 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 536 / 6230144 -- -- -- 536 / 6230144 --
stomach 14 / 26641 20 / 65644 18 / 124767 56 / 448716 14 / 26641 20 / 65644 18 / 124767 56 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 39 / 143630 101 / 100058 -- 3876 / 12372003 39 / 143630 101 / 100058 -- 3876 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 10 / 32606 14 / 115938 20 / 124664 1 / 11737 10 / 32606 14 / 115938 20 / 124664
uncharacterized tissue 78 / 207932 252 / 479819 1 / 21833 18 / 51729 78 / 207932 252 / 479819 1 / 21833 18 / 51729
uterus 5 / 38063 64 / 133582 1031 / 10193077 -- 5 / 38063 64 / 133582 1031 / 10193077 --
vascular 33 / 46250 -- 2434 / 13135050 -- 33 / 46250 -- 2434 / 13135050 --
white blood cells -- -- 31 / 846268 -- -- -- 31 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --