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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.529778Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 51 / 3316537 82 / 2498449 3123 / 114162531 6663 / 109592465 51 / 3316537 82 / 2498449 3123 / 114162531 6663 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   10 / 29891 15 / 5047110 8 / 4978364 0 / 14774 10 / 29891 15 / 5047110 8 / 4978364
brain   9 / 200215 3 / 729526 51 / 4997811 0 / 506301 9 / 200215 3 / 729526 51 / 4997811
cartilage     -- 4 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum       26 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 26 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   1 / 151167 1 / 98089 7 / 643586 0 / 26551 1 / 151167 1 / 98089 7 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       1962 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 1962 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   2 / 89898 1 / 155372 2 / 100281 0 / 106627 2 / 89898 1 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 3 / 107249   4 / 214987 5 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 2 / 128150     1 / 159059 2 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 7 / 62650 1 / 27007 171 / 5278419 967 / 4863489 7 / 62650 1 / 27007 171 / 5278419 967 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 1 / 104307 74 / 43166038 605 / 30312656 2 / 46553 1 / 104307 74 / 43166038 605 / 30312656
muscle 3 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 3 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       2 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 -- 1 / 241088 1 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   1 / 107080 3 / 266949 6 / 491794 0 / 79993 1 / 107080 3 / 266949 6 / 491794
retina   -- 2 / 820326 6 / 88490 0 / 29438 -- 2 / 820326 6 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 814 / 26905847 2032 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 814 / 26905847 2032 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 600 / 6230144 -- -- -- 600 / 6230144 --
stomach   4 / 65644 4 / 124767 1 / 448716 0 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 15 / 100058 -- 967 / 12372003 5 / 143630 15 / 100058 -- 967 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 11 / 207932 27 / 479819 1 / 21833 9 / 51729 11 / 207932 27 / 479819 1 / 21833 9 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 108 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 108 / 10193077 --
vascular   -- 1310 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 1310 / 13135050 --
white blood cells -- -- 13 / 846268 -- -- -- 13 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --