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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.529408Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 143 / 3316537 233 / 2498449 1066 / 114162531 1419 / 109592465 143 / 3316537 233 / 2498449 1066 / 114162531 1419 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 12 / 57865 --   3 / 16077 12 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 1 / 29891 1 / 5047110   1 / 14774 1 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 4 / 506301 2 / 200215 9 / 729526 90 / 4997811 4 / 506301 2 / 200215 9 / 729526 90 / 4997811
cartilage 3 / 15965 9 / 37226 -- 6 / 778035 3 / 15965 9 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum     1 / 90885 10 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 10 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 5 / 3888 10 / 44577 -- -- 5 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 19 / 151167 6 / 98089 2 / 643586 2 / 26551 19 / 151167 6 / 98089 2 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 1 / 46440   10 / 12434232 9 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 10 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803     -- 3 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 13 / 76442     -- 13 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 7 / 106627 12 / 89898 3 / 155372 3 / 100281 7 / 106627 12 / 89898 3 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 1 / 107249   14 / 214987 1 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 14 / 214987
lung 10 / 128150 13 / 170663 6 / 159917 1 / 159059 10 / 128150 13 / 170663 6 / 159917 1 / 159059
lymph node   1 / 27007 211 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 211 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 12 / 104307 66 / 43166038 431 / 30312656 11 / 46553 12 / 104307 66 / 43166038 431 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836   2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   14 / 89988 5 / 94887 7 / 179472 0 / 11462 14 / 89988 5 / 94887 7 / 179472
pancreas   12 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 15 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 -- 15 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 11 / 276455   -- -- 11 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 8 / 107080 6 / 266949 3 / 491794 5 / 79993 8 / 107080 6 / 266949 3 / 491794
retina   -- 1 / 820326   0 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 15 / 73633 34 / 125377 373 / 26905847 720 / 34522313 15 / 73633 34 / 125377 373 / 26905847 720 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 9 / 6230144 -- -- -- 9 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 13 / 65644 13 / 124767 31 / 448716 1 / 26641 13 / 65644 13 / 124767 31 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 78 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 78 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 5 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 41 / 479819   3 / 51729 5 / 207932 41 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 1 / 38063 10 / 133582 32 / 10193077 -- 1 / 38063 10 / 133582 32 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 309 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 309 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --