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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.528803Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 880 / 3316537 670 / 2498449 6848 / 114162531 11204 / 109592465 880 / 3316537 670 / 2498449 6848 / 114162531 11204 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 13 / 57865 --   2 / 16077 13 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 5 / 14774 12 / 29891 413 / 5047110 455 / 4978364 5 / 14774 12 / 29891 413 / 5047110 455 / 4978364
brain 145 / 506301 55 / 200215 54 / 729526 543 / 4997811 145 / 506301 55 / 200215 54 / 729526 543 / 4997811
cartilage 1 / 15965 11 / 37226 -- 68 / 778035 1 / 15965 11 / 37226 -- 68 / 778035
cerebellum 46 / 90353   7 / 90885 171 / 1495938 46 / 90353 0 / 0 7 / 90885 171 / 1495938
cerebrum 38 / 198932 3 / 3422 -- -- 38 / 198932 3 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 10 / 44577 -- -- 1 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 28 / 26551 36 / 151167 10 / 98089 31 / 643586 28 / 26551 36 / 151167 10 / 98089 31 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 55 / 246043   -- -- 55 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 9 / 19564   -- -- 9 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 19 / 128826 24 / 46440 6 / 85898 882 / 12434232 19 / 128826 24 / 46440 6 / 85898 882 / 12434232
gastrointestinal tract 8 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 8 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 75 / 76442   35 / 83063 -- 75 / 76442 0 / 1 35 / 83063 --
kidney 32 / 106627 20 / 89898 21 / 155372 3 / 100281 32 / 106627 20 / 89898 21 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 27 / 96846 35 / 107249 3 / 66308 16 / 214987 27 / 96846 35 / 107249 3 / 66308 16 / 214987
lung 28 / 128150 37 / 170663 17 / 159917 5 / 159059 28 / 128150 37 / 170663 17 / 159917 5 / 159059
lymph node 10 / 62650 7 / 27007 324 / 5278419 390 / 4863489 10 / 62650 7 / 27007 324 / 5278419 390 / 4863489
lymphoreticular 2 / 17836 6 / 44303 -- -- 2 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 41 / 104307 169 / 43166038 3439 / 30312656 2 / 46553 41 / 104307 169 / 43166038 3439 / 30312656
muscle 34 / 74039 4 / 27691 24 / 107836 1 / 61270 34 / 74039 4 / 27691 24 / 107836 1 / 61270
nervous 5 / 10333   -- -- 5 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 8 / 11462 10 / 89988 7 / 94887 13 / 179472 8 / 11462 10 / 89988 7 / 94887 13 / 179472
pancreas 2 / 7237 19 / 74930 5 / 85728 13 / 189999 2 / 7237 19 / 74930 5 / 85728 13 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 12 / 30072 -- -- 10 / 96524 12 / 30072 -- --
parathyroid   8 / 20557 -- -- 0 / 24 8 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 4 / 13260   -- -- 4 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 48 / 241088 10 / 39531 19 / 207348 -- 48 / 241088 10 / 39531 19 / 207348 --
pooled tissue 39 / 276455   -- -- 39 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 25 / 79993 24 / 107080 34 / 266949 50 / 491794 25 / 79993 24 / 107080 34 / 266949 50 / 491794
retina 18 / 29438 -- 159 / 820326 2 / 88490 18 / 29438 -- 159 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 14 / 73633 24 / 125377 2310 / 26905847 3263 / 34522313 14 / 73633 24 / 125377 2310 / 26905847 3263 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 8 / 52939   -- -- 8 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1097 / 6230144 -- -- -- 1097 / 6230144 --
stomach 11 / 26641 40 / 65644 9 / 124767 54 / 448716 11 / 26641 40 / 65644 9 / 124767 54 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 22 / 143630 24 / 100058 -- 1756 / 12372003 22 / 143630 24 / 100058 -- 1756 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 13 / 32606 13 / 115938 39 / 124664 3 / 11737 13 / 32606 13 / 115938 39 / 124664
uncharacterized tissue 59 / 207932 122 / 479819 2 / 21833 10 / 51729 59 / 207932 122 / 479819 2 / 21833 10 / 51729
uterus 10 / 38063 39 / 133582 792 / 10193077 -- 10 / 38063 39 / 133582 792 / 10193077 --
vascular 16 / 46250 -- 1296 / 13135050 -- 16 / 46250 -- 1296 / 13135050 --
white blood cells -- -- 20 / 846268 -- -- -- 20 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --