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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.527980Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 255 / 3316537 223 / 2498449 7331 / 114162531 5935 / 109592465 255 / 3316537 223 / 2498449 7331 / 114162531 5935 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 6 / 57865 -- 31 / 83577 1 / 16077 6 / 57865 -- 31 / 83577
bone marrow 1 / 14774 6 / 29891 67 / 5047110 154 / 4978364 1 / 14774 6 / 29891 67 / 5047110 154 / 4978364
brain 21 / 506301 32 / 200215 33 / 729526 258 / 4997811 21 / 506301 32 / 200215 33 / 729526 258 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 63 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 63 / 778035
cerebellum 1 / 90353   3 / 90885 74 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 3 / 90885 74 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 9 / 151167 3 / 98089 30 / 643586 1 / 26551 9 / 151167 3 / 98089 30 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 27 / 246043   -- -- 27 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 3 / 46440 16 / 85898 1988 / 12434232 8 / 128826 3 / 46440 16 / 85898 1988 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 3 / 76442   2 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 2 / 106627 8 / 89898 18 / 155372 12 / 100281 2 / 106627 8 / 89898 18 / 155372 12 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 9 / 107249   2 / 214987 7 / 96846 9 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 15 / 128150 30 / 170663 10 / 159917 14 / 159059 15 / 128150 30 / 170663 10 / 159917 14 / 159059
lymph node 29 / 62650 4 / 27007 177 / 5278419 143 / 4863489 29 / 62650 4 / 27007 177 / 5278419 143 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland   6 / 104307 3952 / 43166038 1792 / 30312656 0 / 46553 6 / 104307 3952 / 43166038 1792 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270 1 / 74039 1 / 27691 2 / 107836 3 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   6 / 89988 20 / 94887 21 / 179472 0 / 11462 6 / 89988 20 / 94887 21 / 179472
pancreas 1 / 7237 2 / 74930 5 / 85728 8 / 189999 1 / 7237 2 / 74930 5 / 85728 8 / 189999
pancreatic islet 22 / 96524   -- -- 22 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260 1 / 1358 -- -- 1 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 -- 11 / 241088 4 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 19 / 276455   -- -- 19 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 12 / 79993 6 / 107080 12 / 266949 46 / 491794 12 / 79993 6 / 107080 12 / 266949 46 / 491794
retina 1 / 29438 -- 28 / 820326 8 / 88490 1 / 29438 -- 28 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 17 / 125377 723 / 26905847 647 / 34522313 4 / 73633 17 / 125377 723 / 26905847 647 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 567 / 6230144 -- -- -- 567 / 6230144 --
stomach   6 / 65644 1 / 124767 33 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 1 / 124767 33 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 16 / 143630 4 / 100058 -- 602 / 12372003 16 / 143630 4 / 100058 -- 602 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 3 / 32606   3 / 124664 1 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue 11 / 207932 37 / 479819 10 / 21833 3 / 51729 11 / 207932 37 / 479819 10 / 21833 3 / 51729
uterus 7 / 38063 9 / 133582 336 / 10193077 -- 7 / 38063 9 / 133582 336 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 1189 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 1189 / 13135050 --
white blood cells -- -- 154 / 846268 -- -- -- 154 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --