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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.527778Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 150 / 3316537 155 / 2498449 336 / 114162531 93 / 109592465 150 / 3316537 155 / 2498449 336 / 114162531 93 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   6 / 29891 1 / 5047110 32 / 4978364 0 / 14774 6 / 29891 1 / 5047110 32 / 4978364
brain 12 / 506301 6 / 200215 2 / 729526 16 / 4997811 12 / 506301 6 / 200215 2 / 729526 16 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 2 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 2 / 90353     2 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum 4 / 198932 2 / 3422 -- -- 4 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   34 / 151167     0 / 26551 34 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 9 / 246043   -- -- 9 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 6 / 128826     2 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 2 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   9 / 89898 1 / 155372   0 / 106627 9 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249   1 / 214987 2 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 19 / 128150   3 / 159917   19 / 128150 0 / 170663 3 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650   4 / 5278419   1 / 62650 0 / 27007 4 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular 13 / 17836 4 / 44303 -- -- 13 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 3 / 104307 300 / 43166038 28 / 30312656 2 / 46553 3 / 104307 300 / 43166038 28 / 30312656
muscle 4 / 74039 10 / 27691   1 / 61270 4 / 74039 10 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988     0 / 11462 7 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   8 / 74930     0 / 7237 8 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 22 / 241088     -- 22 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 2 / 107080     1 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 0 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 13 / 125377 12 / 26905847 8 / 34522313 3 / 73633 13 / 125377 12 / 26905847 8 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 6 / 6230144 -- -- -- 6 / 6230144 --
stomach   10 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 10 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 1 / 143630 1 / 100058 --   1 / 143630 1 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 3 / 32606     1 / 11737 3 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 36 / 207932 23 / 479819     36 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 6 / 133582 4 / 10193077 -- 2 / 38063 6 / 133582 4 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- -- 3 / 846268 -- -- -- 3 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --