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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.526521Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 876 / 3316537 560 / 2498449 20946 / 114162531 30491 / 109592465 876 / 3316537 560 / 2498449 20946 / 114162531 30491 / 109592465
adrenal cortex -- 6 / 9928 -- -- -- 6 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 20 / 57865 --   3 / 16077 20 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 6 / 14774 13 / 29891 170 / 5047110 153 / 4978364 6 / 14774 13 / 29891 170 / 5047110 153 / 4978364
brain 61 / 506301 19 / 200215 305 / 729526 1535 / 4997811 61 / 506301 19 / 200215 305 / 729526 1535 / 4997811
cartilage   14 / 37226 -- 83 / 778035 0 / 15965 14 / 37226 -- 83 / 778035
cerebellum 11 / 90353   32 / 90885 484 / 1495938 11 / 90353 0 / 0 32 / 90885 484 / 1495938
cerebrum 94 / 198932   -- -- 94 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon   28 / 151167 13 / 98089 128 / 643586 0 / 26551 28 / 151167 13 / 98089 128 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 88 / 246043   -- -- 88 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 27 / 128826 20 / 46440 11 / 85898 9599 / 12434232 27 / 128826 20 / 46440 11 / 85898 9599 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803 4 / 12721 18 / 45908 -- 4 / 28803 4 / 12721 18 / 45908 --
heart 44 / 76442   222 / 83063 -- 44 / 76442 0 / 1 222 / 83063 --
kidney 38 / 106627 13 / 89898 36 / 155372 18 / 100281 38 / 106627 13 / 89898 36 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 21 / 96846 22 / 107249 20 / 66308 46 / 214987 21 / 96846 22 / 107249 20 / 66308 46 / 214987
lung 35 / 128150 20 / 170663 28 / 159917 38 / 159059 35 / 128150 20 / 170663 28 / 159917 38 / 159059
lymph node   9 / 27007 1358 / 5278419 1615 / 4863489 0 / 62650 9 / 27007 1358 / 5278419 1615 / 4863489
lymphoreticular   10 / 44303 -- -- 0 / 17836 10 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 40 / 104307 3390 / 43166038 5390 / 30312656 2 / 46553 40 / 104307 3390 / 43166038 5390 / 30312656
muscle 71 / 74039 3 / 27691 70 / 107836 13 / 61270 71 / 74039 3 / 27691 70 / 107836 13 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 21 / 11462 9 / 89988 27 / 94887 44 / 179472 21 / 11462 9 / 89988 27 / 94887 44 / 179472
pancreas 8 / 7237 5 / 74930 22 / 85728 31 / 189999 8 / 7237 5 / 74930 22 / 85728 31 / 189999
pancreatic islet 31 / 96524 6 / 30072 -- -- 31 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   32 / 20557 -- -- 0 / 24 32 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 4 / 13260 1 / 1358 -- -- 4 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 14 / 39531 49 / 207348 -- 20 / 241088 14 / 39531 49 / 207348 --
pooled tissue 88 / 276455   -- -- 88 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 20 / 107080 59 / 266949 101 / 491794 8 / 79993 20 / 107080 59 / 266949 101 / 491794
retina 11 / 29438 -- 562 / 820326 65 / 88490 11 / 29438 -- 562 / 820326 65 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 47 / 73633 41 / 125377 7938 / 26905847 8298 / 34522313 47 / 73633 41 / 125377 7938 / 26905847 8298 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2067 / 6230144 -- -- -- 2067 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 7 / 65644 73 / 124767 134 / 448716 4 / 26641 7 / 65644 73 / 124767 134 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 13 / 100058 -- 2633 / 12372003 11 / 143630 13 / 100058 -- 2633 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 36 / 32606 28 / 115938 62 / 124664 1 / 11737 36 / 32606 28 / 115938 62 / 124664
uncharacterized tissue 68 / 207932 94 / 479819 3 / 21833 21 / 51729 68 / 207932 94 / 479819 3 / 21833 21 / 51729
uterus 18 / 38063 32 / 133582 1577 / 10193077 -- 18 / 38063 32 / 133582 1577 / 10193077 --
vascular 11 / 46250 -- 2787 / 13135050 -- 11 / 46250 -- 2787 / 13135050 --
white blood cells -- -- 81 / 846268 -- -- -- 81 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --