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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.525600Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2461 / 3316537 2603 / 2498449 15162 / 114162531 33851 / 109592465 2461 / 3316537 2603 / 2498449 15162 / 114162531 33851 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 59 / 57865 -- 2 / 83577 4 / 16077 59 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 23 / 14774 80 / 29891 2264 / 5047110 1218 / 4978364 23 / 14774 80 / 29891 2264 / 5047110 1218 / 4978364
brain 615 / 506301 118 / 200215 297 / 729526 1799 / 4997811 615 / 506301 118 / 200215 297 / 729526 1799 / 4997811
cartilage 10 / 15965 26 / 37226 -- 176 / 778035 10 / 15965 26 / 37226 -- 176 / 778035
cerebellum 44 / 90353   20 / 90885 696 / 1495938 44 / 90353 0 / 0 20 / 90885 696 / 1495938
cerebrum 407 / 198932 30 / 3422 -- -- 407 / 198932 30 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 13 / 44577 -- -- 2 / 3888 13 / 44577 -- --
colon 16 / 26551 113 / 151167 9 / 98089 87 / 643586 16 / 26551 113 / 151167 9 / 98089 87 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 113 / 246043   -- -- 113 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 21 / 19564 1 / 2857 -- -- 21 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   144 / 17290 -- -- 0 / 270 144 / 17290 -- --
eye 44 / 128826 23 / 46440 20 / 85898 4307 / 12434232 44 / 128826 23 / 46440 20 / 85898 4307 / 12434232
gastrointestinal tract 24 / 28803 10 / 12721 11 / 45908 -- 24 / 28803 10 / 12721 11 / 45908 --
heart 54 / 76442   20 / 83063 -- 54 / 76442 0 / 1 20 / 83063 --
kidney 63 / 106627 82 / 89898 65 / 155372 4 / 100281 63 / 106627 82 / 89898 65 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 62 / 96846 175 / 107249 17 / 66308 35 / 214987 62 / 96846 175 / 107249 17 / 66308 35 / 214987
lung 133 / 128150 98 / 170663 38 / 159917 46 / 159059 133 / 128150 98 / 170663 38 / 159917 46 / 159059
lymph node 15 / 62650 11 / 27007 778 / 5278419 671 / 4863489 15 / 62650 11 / 27007 778 / 5278419 671 / 4863489
lymphoreticular 9 / 17836 19 / 44303 -- -- 9 / 17836 19 / 44303 -- --
mammary gland 109 / 46553 151 / 104307 2321 / 43166038 14727 / 30312656 109 / 46553 151 / 104307 2321 / 43166038 14727 / 30312656
muscle 26 / 74039 11 / 27691 13 / 107836 2 / 61270 26 / 74039 11 / 27691 13 / 107836 2 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 6 / 11462 64 / 89988 54 / 94887 78 / 179472 6 / 11462 64 / 89988 54 / 94887 78 / 179472
pancreas 4 / 7237 36 / 74930 13 / 85728 36 / 189999 4 / 7237 36 / 74930 13 / 85728 36 / 189999
pancreatic islet 20 / 96524 11 / 30072 -- -- 20 / 96524 11 / 30072 -- --
parathyroid   6 / 20557 -- -- 0 / 24 6 / 20557 -- --
peripheral nervous system 18 / 14891   -- -- 18 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 4 / 6170 -- -- -- 4 / 6170 -- -- --
pituitary gland 11 / 13260 1 / 1358 -- -- 11 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 93 / 241088 28 / 39531 34 / 207348 -- 93 / 241088 28 / 39531 34 / 207348 --
pooled tissue 52 / 276455   -- -- 52 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 56 / 79993 104 / 107080 29 / 266949 151 / 491794 56 / 79993 104 / 107080 29 / 266949 151 / 491794
retina 21 / 29438 -- 349 / 820326 23 / 88490 21 / 29438 -- 349 / 820326 23 / 88490
salivary gland 6 / 2490 1 / 10368 -- -- 6 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 31 / 73633 166 / 125377 1949 / 26905847 2435 / 34522313 31 / 73633 166 / 125377 1949 / 26905847 2435 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 18 / 52939   -- -- 18 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2604 / 6230144 -- -- -- 2604 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 68 / 65644 93 / 124767 415 / 448716 3 / 26641 68 / 65644 93 / 124767 415 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 118 / 143630 97 / 100058 -- 6893 / 12372003 118 / 143630 97 / 100058 -- 6893 / 12372003
thymus 3 / 4478   -- -- 3 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 19 / 32606 70 / 115938 33 / 124664 2 / 11737 19 / 32606 70 / 115938 33 / 124664
uncharacterized tissue 117 / 207932 734 / 479819 3 / 21833 17 / 51729 117 / 207932 734 / 479819 3 / 21833 17 / 51729
uterus 7 / 38063 101 / 133582 1970 / 10193077 -- 7 / 38063 101 / 133582 1970 / 10193077 --
vascular 50 / 46250 -- 2005 / 13135050 -- 50 / 46250 -- 2005 / 13135050 --
white blood cells -- -- 116 / 846268 -- -- -- 116 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --