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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.524094Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 180 / 3316537 227 / 2498449 2865 / 114162531 2385 / 109592465 180 / 3316537 227 / 2498449 2865 / 114162531 2385 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   6 / 57865 -- 5 / 83577 0 / 16077 6 / 57865 -- 5 / 83577
bone marrow   1 / 29891 45 / 5047110 60 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 45 / 5047110 60 / 4978364
brain 22 / 506301 12 / 200215 33 / 729526 207 / 4997811 22 / 506301 12 / 200215 33 / 729526 207 / 4997811
cartilage   7 / 37226 -- 17 / 778035 0 / 15965 7 / 37226 -- 17 / 778035
cerebellum 1 / 90353   8 / 90885 33 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 8 / 90885 33 / 1495938
cerebrum 5 / 198932 1 / 3422 -- -- 5 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 5 / 643586 3 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 21 / 246043   -- -- 21 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 297 / 12434232 9 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 297 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442     -- 4 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 4 / 106627 8 / 89898 1 / 155372 3 / 100281 4 / 106627 8 / 89898 1 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 6 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 5 / 96846 6 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 15 / 128150 9 / 170663 4 / 159917 5 / 159059 15 / 128150 9 / 170663 4 / 159917 5 / 159059
lymph node     109 / 5278419 64 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 109 / 5278419 64 / 4863489
lymphoreticular   4 / 44303 -- -- 0 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland   16 / 104307 1671 / 43166038 408 / 30312656 0 / 46553 16 / 104307 1671 / 43166038 408 / 30312656
muscle 1 / 74039 4 / 27691 1 / 107836 2 / 61270 1 / 74039 4 / 27691 1 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 3 / 89988 1 / 94887 2 / 179472 2 / 11462 3 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas   3 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 3 / 39531 1 / 207348 -- 11 / 241088 3 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 45 / 107080 5 / 266949 10 / 491794 5 / 79993 45 / 107080 5 / 266949 10 / 491794
retina 4 / 29438 -- 12 / 820326 3 / 88490 4 / 29438 -- 12 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 16 / 125377 273 / 26905847 575 / 34522313 2 / 73633 16 / 125377 273 / 26905847 575 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 207 / 6230144 -- -- -- 207 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 8 / 65644   9 / 448716 2 / 26641 8 / 65644 0 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 22 / 143630 14 / 100058 -- 668 / 12372003 22 / 143630 14 / 100058 -- 668 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 6 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 12 / 207932 36 / 479819   4 / 51729 12 / 207932 36 / 479819 0 / 21833 4 / 51729
uterus 6 / 38063 7 / 133582 267 / 10193077 -- 6 / 38063 7 / 133582 267 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 202 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 202 / 13135050 --
white blood cells -- -- 15 / 846268 -- -- -- 15 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --