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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.523739Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 698 / 3316537 377 / 2498449 24737 / 114162531 4230 / 109592465 698 / 3316537 377 / 2498449 24737 / 114162531 4230 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 5 / 16077 2 / 57865 -- 7 / 83577 5 / 16077 2 / 57865 -- 7 / 83577
bone marrow   8 / 29891 1348 / 5047110 838 / 4978364 0 / 14774 8 / 29891 1348 / 5047110 838 / 4978364
brain 168 / 506301 47 / 200215 14 / 729526 48 / 4997811 168 / 506301 47 / 200215 14 / 729526 48 / 4997811
cartilage 2 / 15965 3 / 37226 -- 9 / 778035 2 / 15965 3 / 37226 -- 9 / 778035
cerebellum 70 / 90353   1 / 90885 10 / 1495938 70 / 90353 0 / 0 1 / 90885 10 / 1495938
cerebrum 89 / 198932   -- -- 89 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 4 / 44577 -- -- 2 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 18 / 151167   8 / 643586 3 / 26551 18 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 14 / 246043   -- -- 14 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564   -- -- 4 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 8 / 128826 1 / 46440   902 / 12434232 8 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 902 / 12434232
gastrointestinal tract 9 / 28803   1 / 45908 -- 9 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 7 / 76442   3 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 24 / 106627 8 / 89898 1 / 155372   24 / 106627 8 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 18 / 107249     10 / 96846 18 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 16 / 128150 11 / 170663   1 / 159059 16 / 128150 11 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node 5 / 62650 8 / 27007 108 / 5278419 12 / 4863489 5 / 62650 8 / 27007 108 / 5278419 12 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 2 / 44303 -- -- 5 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 11 / 104307 21098 / 43166038 1315 / 30312656 3 / 46553 11 / 104307 21098 / 43166038 1315 / 30312656
muscle 8 / 74039     3 / 61270 8 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 12 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 3 / 11462 12 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524 6 / 30072 -- -- 6 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 64 / 241088 3 / 39531   -- 64 / 241088 3 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 8 / 107080 2 / 266949 7 / 491794 11 / 79993 8 / 107080 2 / 266949 7 / 491794
retina   -- 4 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 4 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 22 / 73633 6 / 125377 805 / 26905847 848 / 34522313 22 / 73633 6 / 125377 805 / 26905847 848 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 22 / 52939   -- -- 22 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 79 / 6230144 -- -- -- 79 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 6 / 65644   4 / 448716 3 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 4 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 30 / 143630 32 / 100058 -- 212 / 12372003 30 / 143630 32 / 100058 -- 212 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 10 / 32606   1 / 124664 3 / 11737 10 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 34 / 207932 124 / 479819     34 / 207932 124 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 8 / 38063 23 / 133582 439 / 10193077 -- 8 / 38063 23 / 133582 439 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 739 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 739 / 13135050 --
white blood cells -- -- 93 / 846268 -- -- -- 93 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --