Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.523500Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 45 / 3316537 19 / 2498449 254 / 114162531 188 / 109592465 45 / 3316537 19 / 2498449 254 / 114162531 188 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain       5 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 0 / 729526 5 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 3 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum       1 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 1 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 1 / 151167     1 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 1 / 246043   -- -- 1 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye         0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 0 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   1 / 89898 1 / 155372   0 / 106627 1 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver         0 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung   6 / 170663 1 / 159917 5 / 159059 0 / 128150 6 / 170663 1 / 159917 5 / 159059
lymph node   2 / 27007 61 / 5278419 23 / 4863489 0 / 62650 2 / 27007 61 / 5278419 23 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   2 / 104307 68 / 43166038 11 / 30312656 0 / 46553 2 / 104307 68 / 43166038 11 / 30312656
muscle 1 / 74039     1 / 61270 1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       6 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 6 / 179472
pancreas   1 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 7 / 276455   -- -- 7 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 4 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 4 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     73 / 26905847 125 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 73 / 26905847 125 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 6230144 --
stomach 2 / 26641   2 / 124767   2 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 2 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 2 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 27 / 207932 5 / 479819     27 / 207932 5 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     24 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 24 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- -- 22 / 846268 -- -- -- 22 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --